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RG108 DNA Methyltransferase inibitore

N. Cat.S2821

RG108 (N-Ftalil-L-triptofano) è un inibitore della DNA methyltransferase con IC50 di 115 nM in un saggio senza cellule, e questo composto non causa intrappolamento di enzimi covalenti.
RG108 DNA Methyltransferase inibitore Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 334.33

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Controllo Qualità

Lotto: Purezza: 99.82%
99.82

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dellattività PMID
human THP1 cells Function assay Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM 18620381
human HepG2 cells Function assay Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM 19167888
rat macrophages Function assay 24 h Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM 19464189
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Function assay 100 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE 25801160
MCF7 Function assay 50 to 500 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER 25801160
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità

Peso molecolare 334.33 Formula

C19H14N2O4

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 48208-26-0 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi N-Phthalyl-L-tryptophan Smiles C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O

Solubilità

In vitro
Lotto:

DMSO : 66 mg/mL (197.4 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 66 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante lesperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non cè una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nellaggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere allaggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno dacqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo dazione

Targets/IC50/Ki
DNA methyltransferase
(Cell-free assay)
115 nM
In vitro
RG108 blocca efficacemente le DNA methyltransferases in vitro e non causa intrappolamento covalente di enzimi nelle linee cellulari umane. L'incubazione di cellule con basse concentrazioni micromolari di questo composto porta a una significativa demetilazione del DNA genomico senza alcuna tossicità rilevabile. Curiosamente, provoca la demetilazione e la riattivazione dei geni soppressori tumorali, ma non influenza la metilazione delle sequenze satelliti centromeriche. In un altro studio, la sintesi e l'analisi in vitro di un coniugato biotinilato di questa sostanza chimica sono investigate per valutare le interazioni con gli enzimi DNA methyltransferase. In uno studio recente, è stato dimostrato che questo composto può ridurre significativamente l'attività delle DNA methyltransferases nelle cellule iPS derivate da SM rispetto alle SM native.
Saggio chinasico
Saggio di metilazione in vitro
Il DNA substrato per il saggio di metilazione in vitro è un frammento di 798 bp (−423/+375 rispetto al codone di inizio) dalla regione promotrice del gene umano p16Ink4a. La reazione di metilazione contiene da 350 a 400 ng di DNA substrato e 4 unità di metilasi M.SssI (0,5 μM) in un volume finale di 50 μL. Questo composto viene aggiunto a concentrazioni finali di 10, 100, 200 e 500 μM, rispettivamente. Le reazioni vengono eseguite a 37 °C per 2 ore. Dopo il completamento, la reazione viene inattivata a 65 °C per 15 minuti e il DNA viene purificato utilizzando un kit di purificazione PCR. Trecento nanogrammi di DNA purificato vengono digeriti per 3 ore a 60 °C con 30 unità di BstUI e analizzati su gel di agarosio Tris-borato EDTA al 2%.
Riferimenti

Supporto tecnico

Istruzioni per la manipolazione

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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