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N. Cat.: S2821
Struttura chimica
| Target correlati | HDAC JAK BET Histone Methyltransferase PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK |
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| Altro DNA Methyltransferase Inibitori | SGI-1027 Zebularine (NSC 309132) GSK3685032 Gamma-Oryzanol β-thujaplicin CM272 Bobcat339 DC-05 2'-Deoxy-5-Fluorocytidine GSK-3484862 |
| Linee cellulari | Tipo di saggio | Concentrazione | Tempo di incubazione | Formulazione | Descrizione dell'attività | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| human THP1 cells | Function assay | Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM | 18620381 | |||
| human HepG2 cells | Function assay | Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM | 19167888 | |||
| rat macrophages | Function assay | 24 h | Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM | 19464189 | ||
| MCF7 | Apoptosis assay | 10 uM | 6 hrs | Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control | 25801160 | |
| MCF7 | Apoptosis assay | 10 uM | 6 hrs | Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control | 25801160 | |
| MCF7 | Function assay | 100 uM | 1 hr | Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE | 25801160 | |
| MCF7 | Function assay | 50 to 500 uM | 1 hr | Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER | 25801160 | |
| SK-N-MC | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells | 29435139 | |||
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| Peso molecolare | 334.33 | Formula | C19H14N2O4 |
Conservazione (Dalla data di ricezione) | |
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| N. CAS | 48208-26-0 | Scarica SDF | Conservazione delle soluzioni stock |
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| Sinonimi | N-Phthalyl-L-tryptophan | Smiles | C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O | ||
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In vitro |
DMSO
: 66 mg/mL
(197.4 mM)
Ethanol : 66 mg/mL Water : Insoluble |
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In vivo |
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Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)
Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)
Risultati del calcolo:
Concentrazione di lavoro: mg/ml;
Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )
Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.
Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.
Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.
| Targets/IC50/Ki |
DNA methyltransferase
(Cell-free assay) 115 nM
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| In vitro |
RG108 effectively blocks DNA methyltransferases in vitro and does not cause covalent enzyme trapping in human cell lines. Incubation of cells with low micromolar concentrations of this compound results in significant demethylation of genomic DNA without any detectable toxicity. Intriguingly, it causes demethylation and reactivation of tumor suppressor genes, but it does not affect the methylation of centromeric satellite sequences. In another study, the synthesis and in vitro analysis of a biotinylated conjugate of this chemical is investigated to evaluate the interactions with DNA methyltransferase enzymes. In a recent study, it is shown this compound can significantly reduce the DNA methyltransferases activity in SM derived iPS cells as compared to the native SMs.
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| Saggio chinasico |
Saggio di metilazione in vitro
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Il DNA substrato per il saggio di metilazione in vitro è un frammento di 798 bp (−423/+375 rispetto al codone di inizio) dalla regione promotrice del gene umano p16Ink4a. La reazione di metilazione contiene da 350 a 400 ng di DNA substrato e 4 unità di metilasi M.SssI (0,5 μM) in un volume finale di 50 μL. Questo composto viene aggiunto a concentrazioni finali di 10, 100, 200 e 500 μM, rispettivamente. Le reazioni vengono eseguite a 37 °C per 2 ore. Dopo il completamento, la reazione viene inattivata a 65 °C per 15 minuti e il DNA viene purificato utilizzando un kit di purificazione PCR. Trecento nanogrammi di DNA purificato vengono digeriti per 3 ore a 60 °C con 30 unità di BstUI e analizzati su gel di agarosio Tris-borato EDTA al 2%.
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Riferimenti |
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