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LY3009120 Raf Inibitore

N. Cat.: S7842

LY3009120 (DP-4978) è un potente inibitore pan-Raf con IC50 di 44 nM, 31-47 nM e 42 nM per A-raf, B-Raf e C-Raf in cellule A375, rispettivamente. Questo composto induce l'autophagy. Fase 1.
LY3009120 Raf Inibitore Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 424.51

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.08%
99.08

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
A375 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human A375 cells after 72 hrs by resazurin assay, IC50=0.0092μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to EphA2 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.02μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to BRAF in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.031μM. 25965804
A375 Function assay 72 hrs Inhibition of BRAF V600E mutant in human A375 cells assessed as inhibition of ERK phosphorylation measured after 72 hrs by ELISA assay, IC50=0.037μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to ZAK in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.039μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to CRAF in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.042μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to ARAF in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.044μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to p38 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.061μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to FYN in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.091μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to MAP3K1 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.098μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to EphB4 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.1μM. 25965804
HCT116 Function assay Inhibition of KRAS G13D mutant in human HCT116 cells assessed as inhibition of ERK phosphorylation by ELISA, IC50=0.15μM. 25965804
A375 Function assay In vivo inhibition of BRAF V600E mutant in human A375 cells xenografted in po dosed NIH nude rat assessed as plasma concentration required to inhibit ERK phosphorylation by 50%, INH=0.165μM. 25965804
HCT116 Antiproliferative assay 67 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 67 hrs by resazurin assay, IC50=0.22μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to CSK in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.29μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to SRC in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.31μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to ABL in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.38μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to IRAK1 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.39μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to GCN2 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.45μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to JNK in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.47μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to MAP2K5 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.8μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to KHS1 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.97μM. 25965804
HCT116 Function assay <100 nM Paradoxical activation of RAS/RAF/MEK signaling pathway in human HCT116 cells expressing wild type BRAF assessed as ERK phosphorylation at <100 nM 25965804
A375 Function assay Inhibition of desthiobiotin-ATP acylphosphate probe binding to B-Raf in human A375 cells by MS analysis, IC50=0.031μM. 30529543
A375 Function assay Inhibition of desthiobiotin-ATP acylphosphate probe binding to C-Raf in human A375 cells by MS analysis, IC50=0.042μM. 30529543
A375 Function assay Inhibition of desthiobiotin-ATP acylphosphate probe binding to A-Raf in human A375 cells by MS analysis, IC50=0.044μM. 30529543
MV4-11 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MV4-11 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.1μM. 30529543
SK-MEL-2 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human SK-MEL-2 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.2μM. 30529543
A375 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human A375 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.3μM. 30529543
SW579 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human SW579 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.9μM. 30529543
HT-29 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HT-29 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.9μM. 30529543
HepG2 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HepG2 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=2.6μM. 30529543
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 424.51 Formula

C23H29FN6O

 Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 1454682-72-4 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi DP-4978 Smiles CC1=CC(=C(C=C1C2=C(N=C3C(=C2)C=NC(=N3)NC)C)NC(=O)NCCC(C)(C)C)F

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 20 mg/mL (47.11 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
C-Raf
(Cell-free assay)
4.3 nM
BRAF(V600E)
(Cell-free assay)
5.8 nM
BRAF WT
(Cell-free assay)
15 nM
In vitro
LY3009120 inhibits the cell growth of A375 and HCT116 cells with the IC50 of 9.2 and 220 μM, respectively. This compound inhibits the tyrosine kinase KDR with the IC50 of 3.9 μM.
Saggio chinasico
Misurazione dell'attività chinasica utilizzando saggi KiNativ
I composti vengono screenati in lisati di cellule A375 utilizzando la sonda basata su ATP a 5 µM. I valori di IC50 sono riportati in unità micromolari. I pellet cellulari vengono risospesi in quattro volumi di tampone di lisi [25 mM Tris pH 7,6, 150 mM NaCl, 1% CHAPS, 1% Tergitol NP-40 tipo, 1% v/v cocktail di inibitori della fosfatasi II], sonicati utilizzando un sonicatore a punta e omogeneizzati con Dounce. I lisati vengono chiarificati mediante centrifugazione a 100.000 g per 30 min. I lisati chiarificati vengono filtrati attraverso un filtro a siringa da 0,22 μM e filtrati su gel nel tampone di reazione [20 mM Hepes pH 7,8, 150 mM NaCl, 0,1% Triton X-100, 1% v/v cocktail di inibitori della fosfatasi II]. Il MnCl2 viene quindi aggiunto al lisato fino a una concentrazione finale di 20 mM prima del trattamento con l'inibitore e della marcatura della sonda. Le concentrazioni finali di inibitore utilizzate per le determinazioni dell'IC50 sono 10, 1, 0,1 e 0,01 μM. Gli esperimenti di competizione con ATP vengono eseguiti a 1.000, 100, 10 e 1 μM di ATP. Tutti i trattamenti con l'inibitore vengono eseguiti a temperatura ambiente.
In vivo
In rats bearing BRAF V600E ST019VR PDX tumors, LY3009120 (15 or 30 mg/kg, p.o.) shows a dose-dependent tumor growth inhibition. In nude rats bearing A375 xenograft, single dose oral treatment with this compound (3 to 50 mg/kg, p.o.) shows a dose dependent inhibition of phospho-ERK, with a dose for 50% inhibition of phospho-ERK (EC50) of 4.36 mg/kg, with plasma concentration to achieve 50% inhibition of phospho-ERK (EC50) of 68.9 ng/mL or 165 nM.
Riferimenti

Applicazioni (Applications)

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot Beclin-1 / Mcl-1 / LC3 / p62 p-EGFR / EGFR / p-BRAF / BRAF / p-CRAF / CRAF / p-MEK / MEK / p-AKT / AKT
S7842-WB2
28382170

Informazioni sullo studio clinico (Clinical Trial Information)

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT Reclutamento Condizioni Sponsor/Collaboratori Data di inizio Fasi
NCT02014116 Terminated
Neoplasms|Neoplasm Metastasis|Melanoma|Carcinoma Non-Small-Cell Lung|Colorectal Neoplasms
Eli Lilly and Company
 November 26 2013 Phase 1

Domande Frequenti (Frequently Asked Questions)

Domanda 1:
I am trying to figure out solubility of this compound for in vivo studies. I need some details on the formulation and how it is made to dissolve the chemical?

Risposta:
It can dissolve in 4% DMSO/30% PEG 300/5% Tween 80/ddH2O at 1 mg/ml clearly, and in 0.5% CMC Na at 30 mg/ml as a suspension.