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CUDC-101 HDAC inhibitor

N. Cat.: S1194

CUDC-101 is a potent multi-targeted inhibitor against HDAC, EGFR and HER2 with IC50 of 4.4 nM, 2.4 nM, and 15.7 nM, and this compound inhibits class I/II HDACs, but not class III, Sir-type HDACs. Phase 1.
CUDC-101 HDAC inhibitor Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 434.49

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.58%
99.58

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
human SK-BR-3 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human SK-BR-3 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.04 μM
MDA-MB-231 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human MDA-MB-231 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.1 μM
human HepG2 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human HepG2 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.13 μM
human SKHEP1 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human SKHEP1 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.22 μM
human Hep3B2 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human Hep3B2 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.23 μM
human BxPC3 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human BxPC3 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.27 μM
human NCI-H358 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human NCI-H358 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.4 μM
human MCF7 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human MCF7 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.55 μM
human HCC827 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human HCC827 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.6 μM
human H460 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human H460 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.7 μM
human Capan1 cells Proliferation assay Antiproliferative activity against human Capan1 cells after hrs by ATP content assay, IC50=0.8 μM
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 434.49 Formula

C24H26N4O4

 Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 1012054-59-9 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi N/A Smiles COC1=C(C=C2C(=C1)N=CN=C2NC3=CC=CC(=C3)C#C)OCCCCCCC(=O)NO

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 43 mg/mL (98.96 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
EGFR
(Cell-free assay)
2.4 nM
HDAC
(Cell-free assay)
4.4 nM
HDAC1
(Cell-free assay)
4.5 nM
HDAC6
(Cell-free assay)
5.1 nM
HDAC3
(Cell-free assay)
9.1 nM
HDAC5
(Cell-free assay)
11.4 nM
HDAC2
(Cell-free assay)
12.6 nM
HDAC4
(Cell-free assay)
13.2 nM
HER2
(Cell-free assay)
15.7 nM
HDAC10
(Cell-free assay)
26.1 nM
HDAC9
(Cell-free assay)
67.2 nM
HDAC8
(Cell-free assay)
79.8 nM
HDAC7
(Cell-free assay)
373 nM
In vitro

Specific for class I and class II HDACs, CUDC-101 does not inhibit class III Sir-type HDACs. This compound displays weak activity against other protein kinases including KDR/VEGFR2, Lyn, Lck, Abl-1, FGFR-2, Flt-3, and Ret with IC50 of 0.85 μM, 0.84 μM, 5.91 μM, 2.89 μM, 3.43 μM, 1.5 μM, abd 3.2 μM, respectively. It displays broad antiproliferative activity in many human cancer cell types with IC50 of 0.04-0.80 μM, exhibiting a higher potency and combinations of vorinostat in most cases. This chemical potently inhibits cancer cell lines. It inhibits the resistant EGFR mutant T790M although its effects are incomplete with an Amax of ~60% of peak enzyme activity after inhibition. This compound treatment increases the acetylation of histone H3 and H4, as well as the acetylation of non-histone substrates of HDAC such as p53 and α-tubulin, in a dose-dependant manner in various cancer cell lines. It also suppresses HER3 expression, Met amplification, and AKT reactivation in tumor cells.

Saggio chinasico
Saggi di inibizione di HDAC, EGFR e HER2
Le attività delle HDAC di Classe I e II sono valutate utilizzando il sistema Biomol Color de Lys. In breve, gli estratti nucleari di cellule HeLa sono utilizzati come fonte di HDAC. Diverse concentrazioni di CUDC-101 vengono aggiunte agli estratti nucleari di cellule HeLa in presenza di un substrato artificiale colorimetrico. Il rivelatore viene aggiunto alla fine del saggio e l'attività enzimatica viene misurata nel lettore di micropiastre Wallac Victor II 1420 a 405 nM. L'attività chinasica di EGFR e HER2 viene misurata utilizzando i kit di saggio chinasico HTScan EGF receptor e HER2. In breve, la proteina di fusione GST-EGFR viene incubata con un substrato peptidico biotinilato sintetico e varie concentrazioni di questo composto in presenza di 400 mM di ATP. Il substrato fosforilato viene catturato con piastre a 96 pozzetti rivestite di streptavidina. Il livello di fosforilazione viene monitorato mediante anticorpi secondari anti-fosfo-tirosina e marcati con europio. La soluzione di potenziamento viene aggiunta alla fine del saggio e l'attività enzimatica viene misurata nel lettore di micropiastre Wallac Victor II 1420 a 615 nM.
In vivo

Administration of CUDC-101 at 120 mg/kg/day induces tumor regression in the Hep-G2 liver cancer model, which is more efficacious at its maximum tolerated dose (25 mg/kg/day) and vorinostat at an equimolar concentration dose (72 mg/kg/day). This compound inhibits the growth of -sensitive H358 NSCLC xenografts in a dose-dependent manner. It also shows potent inhibition of tumor growth in the -resistant A549 NSCLC xenograft model. This chemical produces significant tumor regression in the -resistant, HER2-negative, EGFR-overexpressing MDA-MB-468 breast cancer model and the EGFR-overexpressing CAL-27 head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) model. Additionally, it inhibits tumor growth in the K-ras mutant HCT116 colorectal and EGFR/HER2 (neu)-expressing HPAC pancreatic cancer models.

Riferimenti

Informazioni sullo studio clinico (Clinical Trial Information)

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT Reclutamento Condizioni Sponsor/Collaboratori Data di inizio Fasi
NCT01702285 Terminated
Cancer
Curis Inc.
 September 2012 Phase 1
NCT01384799 Completed
Head and Neck Cancer
Curis Inc.
 November 2011 Phase 1
NCT00728793 Completed
Tumors
Curis Inc.
 August 2008 Phase 1