solo per uso di ricerca

(E/Z)-TG003 CDK inibitore

N. Cat.S7320

(E/Z)-TG003 è un potente inibitore ATP-competitivo della Cdc2-like kinase (Clk) con IC50 di 20 nM, 200 nM e 15 nM rispettivamente per Clk1, Clk2 e Clk4. Nessun effetto inibitorio su Clk3, SRPK1, SRPK2 o PKC.
(E/Z)-TG003 CDK inibitore Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 249.33

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Controllo Qualità

Lotto: S732001 DMSO]50 mg/mL]false]Ethanol]50 mg/mL]false]Water]Insoluble]false Purezza: 99.67%
99.67

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dellattività PMID
human STO cells Function assay Modulation of Clk/sty pre-mRNA splicing in human STO cells assessed as concentration required to increase in mature Clk2 mRNA level by RT-PCR analysis, EC50=6.6 μM
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità

Peso molecolare 249.33 Formula

C13H15NO2S

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 300801-52-9 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi N/A Smiles CCN1C2=C(C=CC(=C2)OC)SC1=CC(=O)C

Solubilità

In vitro
Lotto:

DMSO : 50 mg/mL (200.53 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 50 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante lesperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non cè una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nellaggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere allaggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno dacqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo dazione

Targets/IC50/Ki
mCLK4
(Cell-free assay)
15 nM
mCLK1
(Cell-free assay)
20 nM
mCLK2
(Cell-free assay)
200 nM
In vitro
TG003 inibisce lo splicing SF2/ASF-dipendente della β-globina umana in vitro tramite la soppressione della fosforilazione mediata da Clk1/Sty. TG003 inibisce l'attività chinasica di Clk1/Sty nelle cellule di mammifero, pur non avendo alcun effetto tossico sulla crescita delle cellule HeLa e COS-7 a una concentrazione di 10 μM. TG003 blocca la produzione di RNA di IL-1β da parte delle piastrine inibendo lo splicing dell'RNA eteronucleare di IL-1β. Durante la differenziazione degli adipociti 3T3-L1, TG003 blocca anche lo splicing alternativo di PKCβII e l'espressione di PPARγ1 e PPARγ2.
Saggio chinasico
Saggio chinasico in vitro
L'attività chinasica di Clks e SRPKs viene analizzata in una miscela di reazione contenente 200 mM Tris-HCl (pH 7.5), 12.5 mM MgCl2, 8 mM ditiotreitolo, 4 mM EGTA, 1–20 μM ATP, 1 μCi di [γ-32P]ATP, 1 μg di peptide sintetico del dominio SF2/ASF RS (NH2-RSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSY-OH) e 0.1–1 μg di chinasi purificate in un volume finale di 40 μL. L'attività della proteina chinasi dipendente da cAMP viene analizzata in una miscela di reazione contenente 80 mM Tris-HCl (pH 7.5), 12.5 mM MgCl2, 8 mM ditiotreitolo, 4 mM EGTA, 10 μM ATP, 1 μCi di [γ-32P]ATP, 5 μg di istone H1 e 1 μg di subunità catalitica purificata della proteina chinasi dipendente da cAMP di ratto. L'attività della proteina chinasi C viene analizzata in una miscela di reazione contenente 200 mM Tris-HCl (pH 7.5), 12.5 mM MgCl2, 1 mM CaCl2, 80 μg/mL di fosfatidilserina, 8 μg/mL di dioleina, 10 μM ATP, 1 μCi di [γ-32P]ATP, 5 μg di istone H1 e 2 μL di proteina chinasi C di ratto parzialmente purificata. La concentrazione finale di Me2SO viene regolata all'1% indipendentemente dalla concentrazione dell'inibitore. La miscela di reazione viene incubata a 30 o 25 °C per proteine ricombinanti di mammifero o Xenopus, rispettivamente, per 10 min, e una metà viene applicata su membrana di fosfocellulosa P81. Le condizioni dell'analisi chinasica, incluso il periodo di incubazione e la concentrazione di chinasi e substrati, sono ottimizzate per mantenere la linearità durante l'incubazione. La membrana viene lavata con soluzione di acido fosforico al 5% (dominio SF2/ASF RS) o soluzione di acido tricloroacetico al 5% (istone H1) per almeno 15 min. La radioattività viene misurata utilizzando un contatore a scintillazione liquida. La radioattività netta viene dedotta sottraendo il conteggio di fondo dalla miscela di reazione senza chinasi, e i dati sono espressi come percentuale rispetto al campione di controllo contenente il solvente.
In vivo
Il TG003 (10 μM) ripristina i difetti embrionali indotti da un'eccessiva attività di Clk in Xenopus.
Riferimenti

Applicazioni

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot CLK1 / SRPK1
S7320-WB1
27397683
Immunofluorescence tubulin / emerin
S7320-IF1
27015110

Supporto tecnico

Istruzioni per la manipolazione

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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