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Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK Inibitore

Name: Doramapimod (BIRB 796)
Brand: Selleck Chemicals
SKU: S1574
Rating: 5 (128 reviews)

N. Cat.S1574

Doramapimod (BIRB 796) è un inibitore pan-p38 MAPK con IC50 di 38 nM, 65 nM, 200 nM e 520 nM per p38α/β/γ/δ in saggi acellulari. Si lega a p38α con K_d di 0,1 nM nelle cellule THP-1, mostrando una selettività 330 volte maggiore rispetto a JNK2, una debole inibizione per c-RAF, Fyn e Lck, e un'inibizione insignificante di ERK-1, SYK, IKK2.

Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK Inibitore Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 527.66

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.99%

99.99

Target correlati	ERK Raf JNK MEK Ras KRas S6 Kinase MAP4K TAK1 Mixed Lineage Kinase
Altro p38 MAPK Inibitori	SB202190 SB203580 (Adezmapimod) PH-797804 Ralimetinib (LY2228820) dimesylate VX-702 Losmapimod SB239063 Neflamapimod (VX-745) BMS-582949 Asiatic Acid

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari	Tipo di saggio	Tempo di incubazione	Descrizione dell'attività	PMID
HOP-92	Growth Inhibition Assay		IC50=24.3838 μM	SANGER
NCI-H2228	Growth Inhibition Assay		IC50=23.6668 μM	SANGER
CAPAN-1	Growth Inhibition Assay		IC50=22.1884 μM	SANGER
SK-MEL-1	Growth Inhibition Assay		IC50=20.3683 μM	SANGER
DB	Growth Inhibition Assay		IC50=18.7923 μM	SANGER
AN3-CA	Growth Inhibition Assay		IC50=18.1 μM	SANGER
EW-13	Growth Inhibition Assay		IC50=17.9516 μM	SANGER
LC-2-ad	Growth Inhibition Assay		IC50=17.4366 μM	SANGER
ES8	Growth Inhibition Assay		IC50=17.167 μM	SANGER
NCI-H1581	Growth Inhibition Assay		IC50=17.0447 μM	SANGER
HMV-II	Growth Inhibition Assay		IC50=14.2309 μM	SANGER
BEN	Growth Inhibition Assay		IC50=13.1264 μM	SANGER
NBsusSR	Growth Inhibition Assay		IC50=10.8235 μM	SANGER
MS-1	Growth Inhibition Assay		IC50=10.8235 μM	SANGER
BFTC-905	Growth Inhibition Assay		IC50=10.1233 μM	SANGER
NCI-SNU-1	Growth Inhibition Assay		IC50=9.06739 μM	SANGER
MPP-89	Growth Inhibition Assay		IC50=8.46251 μM	SANGER
T-24	Growth Inhibition Assay		IC50=8.40673 μM	SANGER
KP-N-YN	Growth Inhibition Assay		IC50=8.2019 μM	SANGER
IST-MES1	Growth Inhibition Assay		IC50=7.95637 μM	SANGER
NCI-H358	Growth Inhibition Assay		IC50=7.538 μM	SANGER
GOTO	Growth Inhibition Assay		IC50=6.39161 μM	SANGER
DU-145	Growth Inhibition Assay		IC50=3.93811 μM	SANGER
EoL-1-cell	Growth Inhibition Assay		IC50=0.34763 μM	SANGER
KYSE-270	Growth Inhibition Assay		IC50=24.5573 μM	SANGER
HCC1806	Growth Inhibition Assay		IC50=24.7799 μM	SANGER
HuO-3N1	Growth Inhibition Assay		IC50=25.8185 μM	SANGER
HOS	Growth Inhibition Assay		IC50=25.9292 μM	SANGER
KYSE-510	Growth Inhibition Assay		IC50=26.1612 μM	SANGER
COLO-741	Growth Inhibition Assay		IC50=26.3329 μM	SANGER
H-EMC-SS	Growth Inhibition Assay		IC50=26.9245 μM	SANGER
HCC1937	Growth Inhibition Assay		IC50=27.2238 μM	SANGER
NCI-H2126	Growth Inhibition Assay		IC50=27.3975 μM	SANGER
NCI-H1703	Growth Inhibition Assay		IC50=28.0413 μM	SANGER
U-2-OS	Growth Inhibition Assay		IC50=28.5515 μM	SANGER
DBTRG-05MG	Growth Inhibition Assay		IC50=28.5651 μM	SANGER
MHH-ES-1	Growth Inhibition Assay		IC50=31.941 μM	SANGER
HCC1419	Growth Inhibition Assay		IC50=32.1119 μM	SANGER
HOP-62	Growth Inhibition Assay		IC50=32.2701 μM	SANGER
AM-38	Growth Inhibition Assay		IC50=32.9931 μM	SANGER
NCI-H2009	Growth Inhibition Assay		IC50=33.4007 μM	SANGER
EM-2	Growth Inhibition Assay		IC50=33.5511 μM	SANGER
SW1116	Growth Inhibition Assay		IC50=34.4838 μM	SANGER
SK-N-AS	Growth Inhibition Assay		IC50=35.0714 μM	SANGER
ChaGo-K-1	Growth Inhibition Assay		IC50=35.6032 μM	SANGER
RT-112	Growth Inhibition Assay		IC50=35.9879 μM	SANGER
HTC-C3	Growth Inhibition Assay		IC50=36.2355 μM	SANGER
SK-NEP-1	Growth Inhibition Assay		IC50=36.6106 μM	SANGER
LB831-BLC	Growth Inhibition Assay		IC50=37.6541 μM	SANGER
CTB-1	Growth Inhibition Assay		IC50=38.4512 μM	SANGER
MOLT-4	Growth Inhibition Assay		IC50=38.8391 μM	SANGER
SW756	Growth Inhibition Assay		IC50=40.9385 μM	SANGER
CAL-72	Growth Inhibition Assay		IC50=42.03 μM	SANGER
KNS-62	Growth Inhibition Assay		IC50=42.6296 μM	SANGER
KARPAS-299	Growth Inhibition Assay		IC50=43.3233 μM	SANGER
HEL	Growth Inhibition Assay		IC50=45.4646 μM	SANGER
KP-4	Growth Inhibition Assay		IC50=46.7361 μM	SANGER
NEC8	Growth Inhibition Assay		IC50=47.1661 μM	SANGER
G-402	Growth Inhibition Assay		IC50=48.7012 μM	SANGER
Sf21	Function assay		Binding affinity to wild type human biotin labelled p38 alpha (9 to 352 residues) expressed in sf21 insect cells SPR analysis, Kd = 0.000123 μM.	28834431
THP1	Function assay		Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.013 μM.	18325768
U937	Antiinflammatory assay	2 hrs	Antiinflammatory activity in differentiated human U937 cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production preincubated for 2 hrs followed by LPS-stimulation for 4 hrs by sandwich ELISA relative to vehicle-treated control, IC50 = 0.015 μM.	26800309
THP1	Function assay		Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM.	19356929
THP1	Function assay		Inhibition of LPS-induced tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) production in THP-1 cells, EC50 = 0.018 μM.	12086485
THP	Function assay		Tested for inhibition of Tumor necrosis factor, alpha in THP cells, EC50 = 0.018 μM.	14561087
THP1	Function assay		Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in THP1 cells, IC50 = 0.018 μM.	17560108
THP1	Function assay		Inhibition of LPS-stimulated TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM.	18462940
HLF	Function assay		Inhibition of p38alpha phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.047 μM.	18602262
HLF	Function assay		Inhibition of HSP27 phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.058 μM.	18602262
HEK293F	Function assay		Inhibition of sodium arsenate activated N-terminal GST-tagged Brugia malayi MPK1 expressed in HEK293F cells using FAM-p38tide as substrate by IMAP assay, IC50 = 0.14 μM.	29541362
BL21(DE3)	Function assay		Inhibition of p38alpha active form expressed in Escherichia coli BL21(DE3) cells by HTRF assay, IC50 = 0.25 μM.	19928858
whole blood cells	Antiinflammatory assay	4 hrs	Antiinflammatory activity in human whole blood cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production after 4 hrs by time-resolved fluorescence assay, IC50 = 0.6 μM.	22749282
A673	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells	29435139
DAOY	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells	29435139
RD	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells	29435139
SK-N-SH	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells	29435139
MG 63 (6-TG R)	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells	29435139
NB1643	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells	29435139
SK-N-MC	qHTS assay		qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells	29435139
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare	527.66	Formula	C₃₁H₃₇N₅O₃	Conservazione (Dalla data di ricezione)	3 anni-20°Cpolvere
N. CAS	285983-48-4	Scarica SDF		Conservazione delle soluzioni stock	1 anno-80°Cin solvente 1 mese-20°Cin solvente
Sinonimi	N/A			Smiles	CC1=CC=C(C=C1)N2C(=CC(=N2)C(C)(C)C)NC(=O)NC3=CC=C(C4=CC=CC=C43)OCCN5CCOCC5

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 100 mg/mL (189.51 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 100 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa	Concentrazione	Volume	Peso molecolare
=	×	×

Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo Lotto:
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Clear solution	5%DMSO 1 40%PEG300 2 5%Tween80 3 50%ddH2O Validato dai laboratori Selleck. Se necessiti di modifiche a questa formulazione, contatta il nostro team di vendita per test personalizzati.	5.000mg/ml (9.48mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 100 mg/ml clarified DMSO stock solution to 400 μL of PEG300, mix evenly to clarify it; add 50 μL of Tween80 to the above system, mix evenly to make it clear; then continue to add 500 μL of ddH2O to adjust the volume to 1 mL. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

Dosaggio: mg/kg Peso medio degli animali: g Volume di dosaggio per animale:μL Numero di animali:

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO + % + % Tween 80 + % ddH₂O

%DMSO+ %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH₂O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Caratteristiche	The first p38 MAPK inhibitor to be tested in a phase III clinical trial.
Targets/IC₅₀/Ki	JNK2 c-RAF Fyn p38α (Cell-free assay) 0.1 nM(Kd) p38α 38 nM
In vitro	Doramapimod (BIRB 796) non mostra inibizione significativa per ERK-1, SYK, IKK2β, ZAP-70, la chinasi del recettore EGF, HER2, la proteina chinasi A (PKA), PKC, PKC-α, PKC-β (I e II) e PKC-γ. Questo composto migliora notevolmente l'affinità di legame formando un legame idrogeno tra l'ossigeno della morfolina e il dominio di legame dell'ATP di p38α. Rappresenta uno degli inibitori più potenti e a più lenta dissociazione contro la p38 MAP chinasi umana attualmente conosciuti. Inibisce potentemente c-Raf-1 e Jnk2α2 con IC50 di 1,4 e 0,1 nM, rispettivamente. BIRB796 inibisce anche l'attività e l'attivazione di SAPK3/p38γ a una concentrazione più alta rispetto a p38α. Blocca la fosforilazione indotta dallo stress della proteina scaffold SAP97, che è un substrato fisiologico di SAPK3/p38γ. Questo composto blocca l'attivazione e l'attività di JNK1/2 nelle cellule HEK293, mentre non inibisce l'attivazione e l'attività di ERK1/ERK2 nelle cellule Hela. Inoltre, il legame di BIRB796 alle p38 MAPK o JNK1/2 compromette la loro fosforilazione da parte della chinasi a monte MKK6 o MKK4 piuttosto che migliorarne la defosforilazione. Blocca la fosforilazione basale e l'up-regulation di p38 MAPK e Hsp27, migliorando così la citotossicità e l'attivazione della caspasi. Questo composto down-regola la secrezione di IL-6 e VEGF nelle BMSC innescata da TNF-α e TGF-β1. Ha uno scaffold pirazolico che posiziona un gruppo t-butile lipofilo nel sito di selettività inferiore e un anello tolylico nel sito di selettività superiore. Questo composto inibisce anche B-Raf e Abl con IC50 di 83 nM e 14,6 μM, rispettivamente.
Saggio chinasico	Procedure per il saggio cellulare THP-1 per l'inibizione della produzione di TNF-α stimolata da LPS
Saggio chinasico	Le cellule THP-1 vengono preincubate in presenza e assenza di Doramapimod (BIRB 796) per 30 min. La miscela cellulare viene stimolata con LPS (1 μg/mL finale) e l'incubazione continua per tutta la notte (18-24 ore) come sopra. Il surnatante viene analizzato per il TNF-α umano mediante un ELISA disponibile in commercio. I dati vengono combinati e analizzati mediante regressione non lineare utilizzando un modello logistico a tre parametri per ottenere un valore di EC50. Questo composto viene analizzato in ogni esperimento e gli intervalli di confidenza al 95% per l'EC50 sono tra 16 e 22 nM.
In vivo	Doramapimod (BIRB 796) (30 mg/kg) inibisce l'84% del TNF-α nei topi stimolati con LPS e dimostra efficacia in un modello murino di artrite indotta da collagene stabilita. Questo composto ha buone prestazioni farmacocinetiche anche dopo somministrazione orale nei topi.
Riferimenti	[1] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11896401/ [2] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12086485/ [3] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15755732/ [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17173546/ [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20621496/ [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561087/

Applicazioni (Applications)

Metodi	Biomarcatori	Immagini	PMID
Western blot	p-p38 / γ-H2AX mTOR / p-S6K / S6K / p-MK2 / MK2 / p-Hsp27 / Hsp27 p-p38 / p38		27082306

Informazioni sullo studio clinico (Clinical Trial Information)

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT	Reclutamento	Condizioni	Sponsor/Collaboratori	Data di inizio	Fasi
NCT02211885	Completed	Healthy	Boehringer Ingelheim	October 2002	Phase 1

C1=C0/X	C1:	LOG(C1):
C2=C1/X	C2:	LOG(C2):
C3=C2/X	C3:	LOG(C3):
C4=C3/X	C4:	LOG(C4):
C5=C4/X	C5:	LOG(C5):
C6=C5/X	C6:	LOG(C6):
C7=C6/X	C7:	LOG(C7):
C8=C7/X	C8:	LOG(C8):