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Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK inibitore

N. Cat.S1574

Doramapimod (BIRB 796) è un inibitore pan-p38 MAPK con IC50 di 38 nM, 65 nM, 200 nM e 520 nM per p38α/β/γ/δ in saggi acellulari. Si lega a p38α con Kd di 0,1 nM nelle cellule THP-1, mostrando una selettività 330 volte maggiore rispetto a JNK2, una debole inibizione per c-RAF, Fyn e Lck, e un'inibizione insignificante di ERK-1, SYK, IKK2.
Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK inibitore Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 527.66

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Controllo Qualità

Lotto: Purezza: 99.99%
99.99

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dellattività PMID
HOP-92 Growth Inhibition Assay IC50=24.3838 μM SANGER
NCI-H2228 Growth Inhibition Assay IC50=23.6668 μM SANGER
CAPAN-1 Growth Inhibition Assay IC50=22.1884 μM SANGER
SK-MEL-1 Growth Inhibition Assay IC50=20.3683 μM SANGER
DB Growth Inhibition Assay IC50=18.7923 μM SANGER
AN3-CA Growth Inhibition Assay IC50=18.1 μM SANGER
EW-13 Growth Inhibition Assay IC50=17.9516 μM SANGER
LC-2-ad Growth Inhibition Assay IC50=17.4366 μM SANGER
ES8 Growth Inhibition Assay IC50=17.167 μM SANGER
NCI-H1581 Growth Inhibition Assay IC50=17.0447 μM SANGER
HMV-II Growth Inhibition Assay IC50=14.2309 μM SANGER
BEN Growth Inhibition Assay IC50=13.1264 μM SANGER
NBsusSR Growth Inhibition Assay IC50=10.8235 μM SANGER
MS-1 Growth Inhibition Assay IC50=10.8235 μM SANGER
BFTC-905 Growth Inhibition Assay IC50=10.1233 μM SANGER
NCI-SNU-1 Growth Inhibition Assay IC50=9.06739 μM SANGER
MPP-89 Growth Inhibition Assay IC50=8.46251 μM SANGER
T-24 Growth Inhibition Assay IC50=8.40673 μM SANGER
KP-N-YN Growth Inhibition Assay IC50=8.2019 μM SANGER
IST-MES1 Growth Inhibition Assay IC50=7.95637 μM SANGER
NCI-H358 Growth Inhibition Assay IC50=7.538 μM SANGER
GOTO Growth Inhibition Assay IC50=6.39161 μM SANGER
DU-145 Growth Inhibition Assay IC50=3.93811 μM SANGER
EoL-1-cell Growth Inhibition Assay IC50=0.34763 μM SANGER
KYSE-270 Growth Inhibition Assay IC50=24.5573 μM SANGER
HCC1806 Growth Inhibition Assay IC50=24.7799 μM SANGER
HuO-3N1 Growth Inhibition Assay IC50=25.8185 μM SANGER
HOS Growth Inhibition Assay IC50=25.9292 μM SANGER
KYSE-510 Growth Inhibition Assay IC50=26.1612 μM SANGER
COLO-741 Growth Inhibition Assay IC50=26.3329 μM SANGER
H-EMC-SS Growth Inhibition Assay IC50=26.9245 μM SANGER
HCC1937 Growth Inhibition Assay IC50=27.2238 μM SANGER
NCI-H2126 Growth Inhibition Assay IC50=27.3975 μM SANGER
NCI-H1703 Growth Inhibition Assay IC50=28.0413 μM SANGER
U-2-OS Growth Inhibition Assay IC50=28.5515 μM SANGER
DBTRG-05MG Growth Inhibition Assay IC50=28.5651 μM SANGER
MHH-ES-1 Growth Inhibition Assay IC50=31.941 μM SANGER
HCC1419 Growth Inhibition Assay IC50=32.1119 μM SANGER
HOP-62 Growth Inhibition Assay IC50=32.2701 μM SANGER
AM-38 Growth Inhibition Assay IC50=32.9931 μM SANGER
NCI-H2009 Growth Inhibition Assay IC50=33.4007 μM SANGER
EM-2 Growth Inhibition Assay IC50=33.5511 μM SANGER
SW1116 Growth Inhibition Assay IC50=34.4838 μM SANGER
SK-N-AS Growth Inhibition Assay IC50=35.0714 μM SANGER
ChaGo-K-1 Growth Inhibition Assay IC50=35.6032 μM SANGER
RT-112 Growth Inhibition Assay IC50=35.9879 μM SANGER
HTC-C3 Growth Inhibition Assay IC50=36.2355 μM SANGER
SK-NEP-1 Growth Inhibition Assay IC50=36.6106 μM SANGER
LB831-BLC Growth Inhibition Assay IC50=37.6541 μM SANGER
CTB-1 Growth Inhibition Assay IC50=38.4512 μM SANGER
MOLT-4 Growth Inhibition Assay IC50=38.8391 μM SANGER
SW756 Growth Inhibition Assay IC50=40.9385 μM SANGER
CAL-72 Growth Inhibition Assay IC50=42.03 μM SANGER
KNS-62 Growth Inhibition Assay IC50=42.6296 μM SANGER
KARPAS-299 Growth Inhibition Assay IC50=43.3233 μM SANGER
HEL Growth Inhibition Assay IC50=45.4646 μM SANGER
KP-4 Growth Inhibition Assay IC50=46.7361 μM SANGER
NEC8 Growth Inhibition Assay IC50=47.1661 μM SANGER
G-402 Growth Inhibition Assay IC50=48.7012 μM SANGER
Sf21 Function assay Binding affinity to wild type human biotin labelled p38 alpha (9 to 352 residues) expressed in sf21 insect cells SPR analysis, Kd = 0.000123 μM. 28834431
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.013 μM. 18325768
U937 Antiinflammatory assay 2 hrs Antiinflammatory activity in differentiated human U937 cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production preincubated for 2 hrs followed by LPS-stimulation for 4 hrs by sandwich ELISA relative to vehicle-treated control, IC50 = 0.015 μM. 26800309
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 19356929
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) production in THP-1 cells, EC50 = 0.018 μM. 12086485
THP Function assay Tested for inhibition of Tumor necrosis factor, alpha in THP cells, EC50 = 0.018 μM. 14561087
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 17560108
THP1 Function assay Inhibition of LPS-stimulated TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 18462940
HLF Function assay Inhibition of p38alpha phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.047 μM. 18602262
HLF Function assay Inhibition of HSP27 phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.058 μM. 18602262
HEK293F Function assay Inhibition of sodium arsenate activated N-terminal GST-tagged Brugia malayi MPK1 expressed in HEK293F cells using FAM-p38tide as substrate by IMAP assay, IC50 = 0.14 μM. 29541362
BL21(DE3) Function assay Inhibition of p38alpha active form expressed in Escherichia coli BL21(DE3) cells by HTRF assay, IC50 = 0.25 μM. 19928858
whole blood cells Antiinflammatory assay 4 hrs Antiinflammatory activity in human whole blood cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production after 4 hrs by time-resolved fluorescence assay, IC50 = 0.6 μM. 22749282
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità

Peso molecolare 527.66 Formula

C31H37N5O3

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 285983-48-4 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi N/A Smiles CC1=CC=C(C=C1)N2C(=CC(=N2)C(C)(C)C)NC(=O)NC3=CC=C(C4=CC=CC=C43)OCCN5CCOCC5

Solubilità

In vitro
Lotto:

DMSO : 100 mg/mL (189.51 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 100 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante lesperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non cè una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nellaggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere allaggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno dacqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo dazione

Caratteristiche
The first p38 MAPK inhibitor to be tested in a phase III clinical trial.
Targets/IC50/Ki
JNK2
c-RAF
Fyn
p38α
(Cell-free assay)
0.1 nM(Kd)
p38α
38 nM
In vitro

Doramapimod (BIRB 796) non mostra inibizione significativa per ERK-1, SYK, IKK2β, ZAP-70, la chinasi del recettore EGF, HER2, la proteina chinasi A (PKA), PKC, PKC-α, PKC-β (I e II) e PKC-γ. Questo composto migliora notevolmente l'affinità di legame formando un legame idrogeno tra l'ossigeno della morfolina e il dominio di legame dell'ATP di p38α. Rappresenta uno degli inibitori più potenti e a più lenta dissociazione contro la p38 MAP chinasi umana attualmente conosciuti.

Inibisce potentemente c-Raf-1 e Jnk2α2 con IC50 di 1,4 e 0,1 nM, rispettivamente.

BIRB796 inibisce anche l'attività e l'attivazione di SAPK3/p38γ a una concentrazione più alta rispetto a p38α. Blocca la fosforilazione indotta dallo stress della proteina scaffold SAP97, che è un substrato fisiologico di SAPK3/p38γ. Questo composto blocca l'attivazione e l'attività di JNK1/2 nelle cellule HEK293, mentre non inibisce l'attivazione e l'attività di ERK1/ERK2 nelle cellule Hela. Inoltre, il legame di BIRB796 alle p38 MAPK o JNK1/2 compromette la loro fosforilazione da parte della chinasi a monte MKK6 o MKK4 piuttosto che migliorarne la defosforilazione.

Blocca la fosforilazione basale e l'up-regulation di p38 MAPK e Hsp27, migliorando così la citotossicità e l'attivazione della caspasi. Questo composto down-regola la secrezione di IL-6 e VEGF nelle BMSC innescata da TNF-α e TGF-β1.

Ha uno scaffold pirazolico che posiziona un gruppo t-butile lipofilo nel sito di selettività inferiore e un anello tolylico nel sito di selettività superiore. Questo composto inibisce anche B-Raf e Abl con IC50 di 83 nM e 14,6 μM, rispettivamente.

Saggio chinasico
Procedure per il saggio cellulare THP-1 per l'inibizione della produzione di TNF-α stimolata da LPS
Le cellule THP-1 vengono preincubate in presenza e assenza di Doramapimod (BIRB 796) per 30 min. La miscela cellulare viene stimolata con LPS (1 μg/mL finale) e l'incubazione continua per tutta la notte (18-24 ore) come sopra. Il surnatante viene analizzato per il TNF-α umano mediante un ELISA disponibile in commercio. I dati vengono combinati e analizzati mediante regressione non lineare utilizzando un modello logistico a tre parametri per ottenere un valore di EC50. Questo composto viene analizzato in ogni esperimento e gli intervalli di confidenza al 95% per l'EC50 sono tra 16 e 22 nM.
In vivo

Doramapimod (BIRB 796) (30 mg/kg) inibisce l'84% del TNF-α nei topi stimolati con LPS e dimostra efficacia in un modello murino di artrite indotta da collagene stabilita.

Questo composto ha buone prestazioni farmacocinetiche anche dopo somministrazione orale nei topi.

Riferimenti
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17173546/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20621496/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561087/

Applicazioni

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot p-p38 / γ-H2AX mTOR / p-S6K / S6K / p-MK2 / MK2 / p-Hsp27 / Hsp27 p-p38 / p38
S1574-WB3
27082306

Informazioni sullo studio clinico

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT Reclutamento Condizioni Sponsor/Collaboratori Data di inizio Fasi
NCT02211885 Completed
Healthy
Boehringer Ingelheim
October 2002 Phase 1

Supporto tecnico

Istruzioni per la manipolazione

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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