uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden

CX-5461 (Pidnarulex) RNA-polymerase I-remmer

Cat.Nr.S2684

CX-5461 (Pidnarulex) is een remmer van rRNA-synthese die selectief de Pol I-gestuurde transcriptie van rRNA remt met een IC50 van 142 nM in HCT-116-, A375- en MIA PaCa-2-cellen. Het heeft geen effect op Pol II en bezit een 250- tot 300-voudige selectiviteit voor remming van rRNA-transcriptie versus DNA-replicatie en eiwittranslatie.
CX-5461 (Pidnarulex) DNA/RNA Synthesis remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Moleculair gewicht: 513.61

Ga naar

Kwaliteitscontrole

Batch: Zuiverheid: 99.07%
99.07

Celkweek, behandeling & werkconcentratie

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
MNNG Cell viability assay 72 h IC50=0.5-1.5 µM 27729807
U2-OS Cell viability assay 72 h IC50=0.5-1.5 µM 27729807
RS4;11 Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
SEM Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
KOPN-8 Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
NALM-6 Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken

Chemische informatie, Opslag en Stabiliteit

Moleculair gewicht 513.61 Formule

C27H27N7O2S

Opslag (Vanaf de ontvangstdatum)
CAS-nr. 1138549-36-6 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles CC1=CN=C(C=N1)CNC(=O)C2=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C5=C(C2=O)C=CC(=N5)N6CCCN(CC6)C

Oplosbaarheid

In vitro
Batch:

DMSO : Insoluble
(Met vocht verontreinigde DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Moleculair gewicht
Verdunningscalculator Moleculair gewicht calculator

In vivo
Batch:

In vivo Formuleringscalculator (Heldere oplossing)

Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme

Targets/IC50/Ki
Pol I-driven transcription of rRNA
(HCT-116, A375, MIA PaCa-2 cells)
142 nM
In vitro

CX-5461 (Pidnarulex) blijkt de rRNA-synthese selectief te remmen (Pol I IC50=142 nM; Pol II IC50 > 25 μM; selectiviteit ~200-voudig) in de HCT-116-cellen. Deze selectieve remming is bevestigd in twee andere menselijke solide tumorcellijnen; melanoom A375 (Pol I IC50 = 113 nM; Pol II IC50 > 25 μM) en pancreaskanker MIA PaCa-2 (Pol I IC50=54 nM; Pol II IC50 ~25 mM). Het bezit een 250- tot 300-voudige selectiviteit voor remming van rRNA-transcriptie versus DNA-replicatie en eiwittranslatie. De verbinding vertoont een brede antiproliferatieve potentie in een panel van kankercellijnen in menselijke kankercellijnen, maar heeft een minimaal effect op de levensvatbaarheid van niet-getransformeerde menselijke cellen. De mediane EC50 over alle geteste cellijnen is 147 nM, doch alle normale cellijnen hebben EC50-waarden van ongeveer 5.000 nM. Evaluatie van de antiproliferatieve dosisrespons voor HCT-116-, A375- en MIA PaCa-2-cellijnen levert EC50-waarden op van 167, 58 en 74 nM. Het induceert autofagie en senescentie in solide tumorcellen, in plaats van apoptose, via een p53-onafhankelijk proces.

Kinase Assay
Pol I en Pol II Transcriptie Assay
Twee kortlevende RNA-transcripten (halfwaardetijden ~20-30 minuten), één geproduceerd door Pol I en één door Pol II, worden gekwantificeerd met qRT-PCR als een maat voor CX-5461 (Pidnarulex)-gerelateerde effecten op transcriptie. De 45S pre-rRNA diende als het Pol I-transcript en het mRNA voor het proto-oncogen c-myc diende als het vergelijkende Pol II-transcript. Zowel Pol I- als Pol II-transcriptie staan erom bekend te worden beïnvloed door algemene cellulaire stress. Om de potentiële effecten van dergelijke stress te minimaliseren, worden cellen slechts gedurende een korte periode (2 uur) blootgesteld aan testmiddelen. Dit is voldoende tijd om deze transcripten met meer dan 90% te verminderen als deze verbinding hun synthese beïnvloedt.
In vivo

CX-5461 (Pidnarulex) is oraal biologisch beschikbaar en vertoont in vivo antitumoractiviteit tegen menselijke solide tumoren in muizenxenograftmodellen. Deze verbinding vertoont significante MIA PaCa-2 TGI met TGI gelijk aan 69% op dag 31. Evenzo vertoont het significante A375 TGI met TGI gelijk aan 79% op dag 32.

Referenties

Toepassingen

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot Cyclin D1 / p53 / p16 53BP1 / γ-H2AX / p-ATM Bcl-2 / Bax / Caspase3 cleaved PARP / cleaved Caspase-9 / cleaved caspase-3 p-AMPK / AMPK / p-mTOR / mTOR EG5 / Histone H3 / p-Histone H3 (S10)
S2684-WB1
29631594
Immunofluorescence Vimentin / Phalloidin / Snail1 Rictor / Calnexin Fibrillarin LC3 γH2AX / 53BP1 / RPA / RAD51 chromosome / telomere F-actin / Aurora B
S2684-IF1
31068593
Growth inhibition assay Cell viability
S2684-viability1
26061708

Informatie klinische proef

(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)

NCT-nummer Rekrutering Aandoeningen Sponsor/Medewerkers Startdatum Fasen
NCT02719977 Completed
Cancer
Canadian Cancer Trials Group|Senhwa Biosciences Inc.|Stand Up To Cancer
June 13 2016 Phase 1

Technische ondersteuning

Gebruiksaanwijzing

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

Als u nog andere vragen heeft, kunt u een bericht achterlaten.

Gelieve uw naam in te voeren.
Gelieve uw e-mailadres in te voeren. Voer een geldig e-mailadres in.
Schrijf alstublieft iets voor ons.

Veelgestelde vragen

Vraag 1:
I want to make it for further in vivo treatment.

Antwoord:
This compound has poor solubility in common vehicles. It can be dissolved in DMF at 3 mg/ml with warming.