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RG108 DNA Methyltransferase inhibiteur

N° Cat.S2821

RG108 (N-Phtalyl-L-tryptophane) est un inhibiteur de la DNA methyltransferase avec un IC50 de 115 nM dans un essai acellulaire, et ce composé ne provoque pas de piégeage d'enzymes covalentes.
RG108 DNA Methyltransferase inhibiteur Chemical Structure

Structure chimique

Poids moléculaire: 334.33

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Contrôle qualité

Lot : Pureté : 99.82%
99.82

Culture cellulaire, traitement et concentration de travail

Lignées cellulaires Type dessai Concentration Temps dincubation Formulation Description de lactivité PMID
human THP1 cells Function assay Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM 18620381
human HepG2 cells Function assay Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM 19167888
rat macrophages Function assay 24 h Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM 19464189
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Function assay 100 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE 25801160
MCF7 Function assay 50 to 500 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER 25801160
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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Informations chimiques, stockage et stabilité

Poids moléculaire 334.33 Formule

C19H14N2O4

Stockage (À partir de la date de réception)
N° CAS 48208-26-0 Télécharger le SDF Stockage des solutions mères

Synonymes N-Phthalyl-L-tryptophan Smiles C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O

Solubilité

In vitro
Lot:

DMSO : 66 mg/mL (197.4 mM)
(Le DMSO contaminé par lhumidité peut réduire la solubilité. Utiliser du DMSO frais et anhydre.)

Ethanol : 66 mg/mL

Water : Insoluble

Calculateur de molarité

Masse Concentration Volume Poids moléculaire
Calculateur de dilution Calculateur de poids moléculaire

In vivo
Lot:

Calculateur de formulation in vivo (Solution claire)

Étape 1 : Entrez les informations ci-dessous (Recommandé : Un animal supplémentaire pour tenir compte des pertes pendant lexpérience)

mg/kg g μL

Étape 2 : Entrez la formulation in vivo (Ceci nest que le calculateur, pas la formulation. Veuillez nous contacter dabord sil ny a pas de formulation in vivo dans la section Solubilité.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Résultats du calcul :

Concentration de travail : mg/ml;

Méthode de préparation du liquide maître DMSO : mg médicament prédissous dans μL DMSO ( Concentration du liquide maître mg/mL, Veuillez nous contacter dabord si la concentration dépasse la solubilité du DMSO du lot de médicament. )

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuiteμL PEG300, mélanger et clarifier, ajouter ensuiteμL Tween 80, mélanger et clarifier, ajouter ensuite μL ddH2O, mélanger et clarifier.

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuite μL Huile de maïs, mélanger et clarifier.

Remarque : 1. Assurez-vous que le liquide est clair avant dajouter le solvant suivant.
2. Assurez-vous dajouter le(s) solvant(s) dans lordre. Vous devez vous assurer que la solution obtenue lors de lajout précédent est une solution claire avant de procéder à lajout du solvant suivant. Des méthodes physiques telles que le vortex, les ultrasons ou le bain-marie peuvent être utilisées pour faciliter la dissolution.

Mécanisme daction

Targets/IC50/Ki
DNA methyltransferase
(Cell-free assay)
115 nM
In vitro
RG108 bloque efficacement les DNA methyltransferases in vitro et ne provoque pas de piégeage covalent d'enzymes dans les lignées cellulaires humaines. L'incubation de cellules avec de faibles concentrations micromolaires de ce composé entraîne une déméthylation significative de l'ADN génomique sans aucune toxicité détectable. Il est intriguant de noter qu'il provoque la déméthylation et la réactivation des gènes suppresseurs de tumeurs, mais qu'il n'affecte pas la méthylation des séquences satellites centromériques. Dans une autre étude, la synthèse et l'analyse in vitro d'un conjugué biotinylé de ce produit chimique sont étudiées pour évaluer les interactions avec les enzymes DNA methyltransferase. Dans une étude récente, il est démontré que ce composé peut réduire significativement l'activité des DNA methyltransferases dans les cellules iPS dérivées de SM par rapport aux SM natifs.
Kinase Assay
Test de méthylation in vitro
L'ADN substrat pour le test de méthylation in vitro est un fragment de 798 pb (−423/+375 par rapport au codon d'initiation) de la région promotrice du gène humain p16Ink4a. La réaction de méthylation contient 350 à 400 ng d'ADN substrat et 4 unités de méthylase M.SssI (0,5 μM) dans un volume final de 50 μL. Ce composé est ajouté à des concentrations finales de 10, 100, 200 et 500 μM, respectivement. Les réactions sont effectuées à 37 °C pendant 2 heures. Après achèvement, la réaction est inactivée à 65 °C pendant 15 minutes et l'ADN est purifié à l'aide du kit de purification PCR. Trois cents nanogrammes d'ADN purifié sont digérés pendant 3 heures à 60 °C avec 30 unités de BstUI et analysés sur des gels d'agarose Tris-borate EDTA à 2 %.
Références

Support technique

Instructions de manipulation

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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