Hygromycin B

N. catalogoS2908 Lotto:S290806

Dati tecnici

Formula	C₂₀H₃₇N₃O₁₃
Peso molecolare	527.52	Numero CAS	31282-04-9
Solubilità (25°C)*	In vitro	Water	100 mg/mL (189.56 mM)
		DMSO	Insoluble
		Ethanol	Insoluble
* <1 mg/ml significa leggermente solubile o insolubile. * Si prega di notare che Selleck testa la solubilità di tutti i composti internamente e la solubilità effettiva può differire leggermente dai valori pubblicati. Ciò è normale ed è dovuto a leggere variazioni da lotto a lotto. * Spedizione a temperatura ambiente (I test di stabilità mostrano che questo prodotto può essere spedito senza alcuna misura di raffreddamento.)

Preparazione delle soluzioni stock

Attività biologica

Descrizione	Hygromycin B (Igrovetina), un antibiotico selettivo efficace sulla maggior parte dei batteri, funghi ed eucarioti superiori, inibisce la sintesi proteica interferendo con la traslocazione e causando errori di traduzione a livello del ribosome 70S.
In vitro	Hygromycin B ha un singolo sito di legame all'interno del 30S, si trova nel solco maggiore dell'elica molto vicino all'asse elicoidale e stabilisce un contatto con i nucleotidi di entrambi i filamenti di RNA nella regione 1490-1500 e 1400–1410. L'anello I di HygB è coinvolto in interazioni non specifiche per la sequenza con gli atomi di ossigeno fosfato dello scheletro di G1494, oltre a interazioni specifiche per la base con G1494 e U1495. Gli anelli II e III formano deboli legami idrogeno specifici per la base con C1404 e U1498, ma il loro ruolo principale è apparentemente quello di posizionare l'anello IV per l'interazione con le basi nella regione 1496–1498. L'anello IV di HygB si trova entro 4 Å dalla seconda base del codone di mRNA legato al sito P. Questo composto (0,38 mM) arresta completamente la crescita delle cellule di lievito in mezzi ricchi. Blocca fortemente la sintesi Polypeptide in estratti acellulari di reticolociti di coniglio, germe di grano e lievito. Inibisce l'allungamento della catena peptidica da parte dei polisomi di lievito prevenendo la traslocazione dipendente dal fattore di allungamento EF-2. Questo antibiotico inibisce (80%) la reazione dipendente dal fattore di allungamento (EF)G-più-GTP di AcPhe-tRNA o di peptidil-tRNA naturale con puromicina in sistemi acellulari di Escherichia coli. Blocca le catene peptidiche nascenti di polisomi endogeni purificati di E. coli o ribosomes programmati con acido poli(uridilico) durante la sintesi di polipeptidi. Inibisce la traslocazione non enzimatica e il rilascio di AcPhe-tRNA dal sito accettore ribosomiale promosso dalla deplezione di ioni NH4. È utilizzato per la selezione della resistenza in cellule L di topo trasfettate con geni di Escherichia coli che codificano per la resistenza agli antibiotici aminociclitolici Hygromycin B. Questa sostanza chimica è usata come marcatore selezionabile per il trasferimento e l'integrazione di T-DNA nel fungo ectomicorrizico Suillus bovinus.

Descrizione

Hygromycin B (Igrovetina), un antibiotico selettivo efficace sulla maggior parte dei batteri, funghi ed eucarioti superiori, inibisce la sintesi proteica interferendo con la traslocazione e causando errori di traduzione a livello del ribosome 70S.

In vitro

Hygromycin B ha un singolo sito di legame all'interno del 30S, si trova nel solco maggiore dell'elica molto vicino all'asse elicoidale e stabilisce un contatto con i nucleotidi di entrambi i filamenti di RNA nella regione 1490-1500 e 1400–1410. L'anello I di HygB è coinvolto in interazioni non specifiche per la sequenza con gli atomi di ossigeno fosfato dello scheletro di G1494, oltre a interazioni specifiche per la base con G1494 e U1495. Gli anelli II e III formano deboli legami idrogeno specifici per la base con C1404 e U1498, ma il loro ruolo principale è apparentemente quello di posizionare l'anello IV per l'interazione con le basi nella regione 1496–1498. L'anello IV di HygB si trova entro 4 Å dalla seconda base del codone di mRNA legato al sito P.

Questo composto (0,38 mM) arresta completamente la crescita delle cellule di lievito in mezzi ricchi. Blocca fortemente la sintesi Polypeptide in estratti acellulari di reticolociti di coniglio, germe di grano e lievito. Inibisce l'allungamento della catena peptidica da parte dei polisomi di lievito prevenendo la traslocazione dipendente dal fattore di allungamento EF-2.

Questo antibiotico inibisce (80%) la reazione dipendente dal fattore di allungamento (EF)G-più-GTP di AcPhe-tRNA o di peptidil-tRNA naturale con puromicina in sistemi acellulari di Escherichia coli. Blocca le catene peptidiche nascenti di polisomi endogeni purificati di E. coli o ribosomes programmati con acido poli(uridilico) durante la sintesi di polipeptidi. Inibisce la traslocazione non enzimatica e il rilascio di AcPhe-tRNA dal sito accettore ribosomiale promosso dalla deplezione di ioni NH4.

È utilizzato per la selezione della resistenza in cellule L di topo trasfettate con geni di Escherichia coli che codificano per la resistenza agli antibiotici aminociclitolici Hygromycin B.

Questa sostanza chimica è usata come marcatore selezionabile per il trasferimento e l'integrazione di T-DNA nel fungo ectomicorrizico Suillus bovinus.

Protocollo (da riferimento)

Riferimenti

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11163189/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/367435/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/208837/

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6096211/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12174821/

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Sellecks Hygromycin B È stato citato da 11 Pubblicazioni

CDK9 recruits HUWE1 to degrade RARα and offers therapeutic opportunities for cutaneous T-cell lymphoma [ Nat Commun, 2024, 15(1):10594]	PubMed: 39632829
UBR5 mediates colorectal cancer chemoresistance by attenuating ferroptosis via Lys 11 ubiquitin-dependent stabilization of Smad3-SLC7A11 signaling [ Redox Biol, 2024, 76:103349]	PubMed: 39260061
The xenobiotic transporter ABCC4/MRP4 promotes epithelial mesenchymal transition in pancreatic cancer [ Front Pharmacol, 2024, 15:1432851]	PubMed: 39114357
APOBEC3B coordinates R-loop to promote replication stress and sensitize cancer cells to ATR/Chk1 inhibitors [ Cell Death Dis, 2023, 14(6):348]	PubMed: 37270643
Detection of Alternative End-Joining in HNSC Cell Lines Using DNA Double-Strand Break Reporter Assays [ Bio Protoc, 2022, 12(17)e4506]	PubMed: 36213110
CGAS is a micronucleophagy receptor for the clearance of micronuclei [ Autophagy, 2021, 1-17]	PubMed: 33752561
The RNA helicase DDX5 promotes viral infection via regulating N6-methyladenosine levels on the DHX58 and NFκB transcripts to dampen antiviral innate immunity [ PLoS Pathog, 2021, 17(4):e1009530]	PubMed: 33909701
[ Cell Res, 2020, ]	PubMed: 32839552
SETDB1-Mediated Cell Fate Transition between 2C-Like and Pluripotent States. [ Cell Rep, 2020, 30(1):25-36]	PubMed: 31914391
[ Sci Rep, 2020, ]	PubMed: 32848164

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