Pracinostat (SB939)

N. catalogoS1515 Lotto:S151503

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Dati tecnici

Formula

C20H30N4O2

Peso molecolare 358.48 Numero CAS 929016-96-6
Solubilità (25°C)* In vitro DMSO 72 mg/mL (200.84 mM)
Ethanol 34 mg/mL (94.84 mM)
Water Insoluble
In vivo (Aggiungere i solventi al prodotto singolarmente e in ordine.)
Homogeneous suspension
CMC-NA
≥5mg/ml Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
* <1 mg/ml significa leggermente solubile o insolubile.
* Si prega di notare che Selleck testa la solubilità di tutti i composti internamente e la solubilità effettiva può differire leggermente dai valori pubblicati. Ciò è normale ed è dovuto a leggere variazioni da lotto a lotto.
* Spedizione a temperatura ambiente (I test di stabilità mostrano che questo prodotto può essere spedito senza alcuna misura di raffreddamento.)

Preparazione delle soluzioni stock

Attività biologica

Descrizione Pracinostat (SB939) è un potente inibitore pan-HDAC con IC50 di 40-140 nM, ad eccezione di HDAC6. Non ha attività contro l'isoenzima di classe III SIRT I. Questo composto induce l'apoptosi nelle cellule tumorali. Fase 2.
Target
HDAC10
(Cell-free assay)
HDAC3
(Cell-free assay)
HDAC5
(Cell-free assay)
HDAC1
(Cell-free assay)
HDAC4
(Cell-free assay)
Visualizza altro
40 nM 43 nM 47 nM 49 nM 56 nM
In vitro

Pracinostat (SB939) ha una selettività 100 volte maggiore per gli HDAC rispetto agli enzimi non-HDAC, ai recettori e ai canali ionici che legano lo Zn. Questo composto è un potente inibitore delle isoenzime HDAC di classe I, HDAC1, HDAC2, HDAC3 e HDAC8 con valori di IC50 che vanno da 43 nM a 140 nM. Inibisce significativamente le isoenzime HDAC di classe II, HDAC4, HDAC5, HDAC7, HDAC9 e HDAC10 con valori di IC50 che vanno da 40 nM a 137 nM, con l'eccezione di HDAC6 che mostra un IC50 di 1008 nM. Inibisce marcatamente HDAC11 delle isoenzime HDAC di classe IV con un IC50 di 93 nM, ma non mostra attività inibitoria contro SIRT 1 delle HDAC di classe III. Questa sostanza chimica mostra una significativa attività antiproliferativa contro un'ampia varietà di linee cellulari tumorali, in particolare cellule di leucemia e cellule di linfoma cutaneo a cellule T con valori di IC50 che vanno da 50 nM (cellule H9) a 170 nM (cellule HEL92.1.7).

In vivo

La somministrazione di questo composto (da 25 mg/kg a 100 mg/kg) mostra un'efficacia antitumorale dose-dipendente in un modello murino di xenotrapianto di cancro colorettale umano (HCT-116). Questo è circa il doppio più efficace del SAHA: questa sostanza chimica causa un'inibizione della crescita tumorale del 94% contro il 48% del SAHA, entrambi alla dose massima tollerata. La somministrazione orale di questo agente a una dose di 50 mg/kg o 75 mg/kg nel modello murino genetico APCmin di cancro al colon in fase iniziale riduce notevolmente il numero di tumori, diminuisce i punteggi cumulativi di emocoltura e aumenta più efficacemente i valori di ematocrito.

Caratteristiche Un nuovo inibitore dell'istone deacetilasi basato sull'acido idrossamico, con proprietà fisico-chimiche, farmaceutiche e farmacocinetiche migliorate.

Protocollo (da riferimento)

Saggio della chinasi:

[1]

  • Saggio enzimatico HDAC

    Tutti gli enzimi HDAC ricombinanti, ad eccezione di SIRT1, vengono clonati ed espressi in S*BIO. La miscela di reazione contenente 2,5 o 5 μL dell'isoenzima HDAC, tampone di saggio (25 mM Tris-HCl, pH 7,5; 137 mM NaCl; 2,7 mM KCl, 1 mM MgCl2 e 1 mg/mL BSA), diverse concentrazioni di questo composto e il substrato fluorogenico deacetilasico Flour de LysTM in un volume di reazione totale di 33 μL viene incubata a temperatura ambiente per 2 ore. Vengono aggiunti 16 μL di sviluppatore Flour de LysTM e incubati per altri 10 minuti. La luce emessa viene misurata a 460 nm in un lettore di micropiastre. I valori di IC50 vengono generati utilizzando il software XLfit.

Saggio cellulare:

[1]

  • Linee cellulari

    HCT116, A2780, ACHN, MCF7, HL-60, et al.

  • Concentrazioni

    Dissolved in DMSO (stock concentration, 10 mM), final concentrations 1.5 nM to 100 μM

  • Tempo di incubazione

    96 hours

  • Metodo

    Cells are seeded in 96-well plates in the log growth phase at a predetermined optimal density, and rested for 24 hours (adherent cells) or 2 hours (suspension cells), respectively. They are exposed to different concentrations of this compound for 96 hours. Cell proliferation assays are done using either the CyQUANT cell proliferation assay kit for adherent cells or the CellTiter96 Aqueous One solution cell proliferation kit for suspension cells.

Studio sugli animali:

[1]

  • Modelli animali

    BALB/c nude mice bearing HCT-116 human colon cancer xenografts, Male and APCmin mice

  • Dosaggi

    25, 50, 75, or 100 mg/kg

  • Somministrazione

    Oral gavage once daily

Riferimenti

  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20197387/

Convalida del prodotto da parte del cliente

Hyperacetylation of P. falciparum proteins by SB939. Synchronous 3D7 trophozoite-stage P. falciparum parasites were treated with 50 or 500 nM chloroquine (CQ), SAHA, or SB939 or with vehicle only (control; 0.05% DMSO) for 3 h. Following saponin lysis, parasite protein lysates were prepared and SDS-PAGE and Western blotting carried out using anti-acetyl H4 or anti-pan-acetyl lysine (K103) antibodies. Coomassie blue staining was carried out as a loading control.

Dati da [ Antimicrob Agents Chemother , 2012 , 56(7), 3849-56 ]

<p>Breast cancer cells were treated with the indicated concentrations of SB939.</p><div><div> </div></div><p> </p>

, , Dr. Zhang of Tianjin Medical University

A significant decrease in detectable PLA signal following HDAC inhibition in SYO-1 cells A, B. is also confirmed by immunoprecipitation C. The decrease in PLA co-localization signal correlates with apoptosis induction by HDAC inhibitor FK228 in SYO-1 cells.

Dati da [ , , Oncotarget, 2016, 7(23):34384-94 ]

(B) Immunoblots showing induction of apoptosis in K562 BIMi2+/+, BIMi2+/- and BIMi2-/-. The data shown are representative of 3 experiments with similar results. Cells were treated for 48hours with SB939 at the indicated concentrations. p-BCR-ABL, phosphorylated BCR-ABL; STAT5, signal transducer and activator of transcription 5; p-STAT5, phosphorylated STAT5; BIMEL, BIM extra long isoform; BIML, BIM long isoform; Cl. CASP3, cleaved CASPASE3; Cl. PARP, cleaved PARP. 48-hour treatment as in A.

Dati da [ , , PLoS One, 2017, 12(3):e0174107 ]

Sellecks Pracinostat (SB939) È stato citato da 25 Pubblicazioni

Functional Characterization of LTR12C as Regulators of Germ-Cell-Associated TA-p63 in U87-MG and T98-G In Vitro Models [ Cells, 2025, 14(11)852] PubMed: 40498028
Targeting histone deacetylase 6 (HDAC6) to enhance radiation therapy in meningiomas in a 2D and 3D in vitro study [ EBioMedicine, 2024, 105:105211] PubMed: 38917510
Epigenetic and molecular coordination between HDAC2 and SMAD3-SKI regulates essential brain tumour stem cell characteristics [ Nat Commun, 2023, 14(1):5051] PubMed: 37598220
Nuclear oligo hashing improves differential analysis of single-cell RNA-seq [ Nat Commun, 2022, 13(1):2666] PubMed: 35562344
The novel histone deacetylase inhibitor pracinostat suppresses the malignant phenotype in human glioma [ Mol Biol Rep, 2022, 10.1007/s11033-022-07559-y] PubMed: 35622308
CREBBP cooperates with the cell cycle machinery to attenuate chidamide sensitivity in relapsed/refractory diffuse large B-cell lymphoma [ Cancer Lett, 2021, 521:268-280] PubMed: 34481935
Exposure of Microglia to Interleukin-4 Represses NF-κB-Dependent Transcription of Toll-Like Receptor-Induced Cytokines [ Front Immunol, 2021, 12:771453] PubMed: 34880868
Identification of Required Host Factors for SARS-CoV-2 Infection in Human Cells [ Cell, 2020, S0092-8674(20)31394-5] PubMed: 33147445
Pracinostat (SB939), a histone deacetylase inhibitor, suppresses breast cancer metastasis and growth by inactivating the IL-6/STAT3 signalling pathways. [ Life Sci, 2020, 248:117469] PubMed: 32109485
Targeting NAD+ Biosynthesis Overcomes Panobinostat and Bortezomib-Induced Malignant Glioma Resistance [ Mol Cancer Res, 2020, 18(7):1004-1017] PubMed: 32238439

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