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BIBF 1120 (Nintedanib) inibitore di PDGFR/VEGFR

N. Cat.S1010

Nintedanib è un potente triplo inibitore dell'angiokinasi per VEGFR1/2/3, FGFR1/2/3 e PDGFRα/β con IC50 di 34 nM/13 nM/13 nM, 69 nM/37 nM/108 nM e 59 nM/65 nM in saggi privi di cellule. Fase 3.
BIBF 1120 (Nintedanib) VEGFR Inibitore Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 539.62

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.98%
99.98

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
SKOV3 Function Assay 5 µM 24 h DMSO induces a significant increase in the promoter activities of E-cad, CDH1, and CDH3 26061747
A549 Function Assay 2/5 μM 24 h DMSO has a general EMT reversal effect  26061747
T24 Function Assay 2/5 μM 24 h DMSO has a general EMT reversal effect  26061747
Mia-Paca2 Function Assay 2/5 μM 24 h DMSO has a general EMT reversal effect  26061747
A549 Function Assay 0.01–5 μM 24 h DMSO induces SFTPD mRNA expression dose dependently 25843005
A549 Function Assay 0.01–5 μM 72 h DMSO enhances SP-D protein expression in a dose-dependent manner at concentrations of up to 5 μM  25843005
A549 Function Assay 5 μM 0-1 h DMSO increases AP-1 activation after 30 min 25843005
Hep3B Cell Viability Assay 0-20 μM 48 h decreases cell viability dose dependently 24657398
HepG2 Cell Viability Assay 0-20 μM 48 h decreases cell viability dose dependently 24657398
PLC5 Cell Viability Assay 0-20 μM 48 h decreases cell viability dose dependently 24657398
HuH7 Cell Viability Assay 0-20 μM 48 h decreases cell viability dose dependently 24657398
SK-Hep1 Cell Viability Assay 0-20 μM 48 h decreases cell viability dose dependently 24657398
Hep3B Apoptosis Assay 0-20 μM 48 h induces cell apoptosis dose dependently 24657398
HepG2 Apoptosis Assay 0-20 μM 48 h induces cell apoptosis dose dependently 24657398
PLC5 Apoptosis Assay 0-20 μM 48 h induces cell apoptosis dose dependently 24657398
HuH7 Apoptosis Assay 0-20 μM 48 h induces cell apoptosis dose dependently 24657398
SK-Hep1 Apoptosis Assay 0-20 μM 48 h induces cell apoptosis dose dependently 24657398
H1703 Growth Inhibition Assay IC50=0.05 μM 23729403
Sf9 Function assay 20 mins Inhibition of mouse GST-fused VEGFR2 expressed in Sf9 insect cells after 20 mins by scintillation counting, IC50 = 0.013 μM. 18559524
Sf9 Function assay 20 mins Inhibition of human GST-fused VEGFR2 expressed in Sf9 insect cells after 20 mins by scintillation counting, IC50 = 0.021 μM. 18559524
NIH3T3 Function assay 50 nM 1 hr Inhibition of VEGFR2 transfected in mouse NIH3T3 cells at 50 nM incubated for 1 hr measured after 32 hrs washout followed by VEGF stimulation for 10 mins by Western blotting 18559524
HT-29 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HT-29 cells after 72 hrs by MTT assay, IC50 = 4.9 μM. 28190652
SKOV3 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human SKOV3 cells after 72 hrs by MTT assay, IC50 = 28.76 μM. 28190652
BL21 (DE3) Function assay 30 mins Inhibition of His6-tagged MELK catalytic domain (1 to 340 residues) (unknown origin) expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Bcl-GL as substrate measured after 30 mins in presence of [gamma32P]ATP by liquid scintillation counting method, Ki = 0.0056 μM. 28351607
BL21 (DE3) Function assay 30 mins Inhibition of His6-tagged MELK catalytic domain (1 to 340 residues) (unknown origin) expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Bcl-GL as substrate measured after 30 mins in presence of [gamma32P]ATP by liquid scintillation counting method, IC50 = 0.043 μM. 28351607
HT-29 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HT-29 cells after 72 hrs by MTT assay, IC50 = 0.83 μM. 28826084
MCF7 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 72 hrs by MTT assay, IC50 = 8.28 μM. 28826084
A549 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human A549 cells after 72 hrs by MTT assay, IC50 = 22.62 μM. 28826084
NIH/3T3 Function assay 42 hrs Inhibition of PDGFR in mouse NIH/3T3 cells assessed as reduction in recombinant human PDGF-BB-induced cell proliferation after 42 hrs by cell titer 96 aqueous one solution based assay, IC50 = 0.085 μM. 29152045
Sf9 Function assay Inhibition of human VEGFR2 expressed in Sf9 cells, IC50 = 0.005 μM. 19522465
NIH3T3 Function assay 1 hr Inhibition of VEGF-stimulated human VEGFR2 phosphorylation expressed in mouse NIH3T3 cells pretreated for 1 hr measured 32 hrs after drug dose by immunoprecipitation based pulse-chase experiment 19522465
BRP Apoptosis assay Induction of apoptosis in BRP cells assessed as caspase-3 cleavage 19522465
BRP Antiangiogenic assay Antiangiogenic activity BRP cells assessed as inhibition of cell proliferation by [3H]thymidine incorporation assay 19522465
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for TC32 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Saos-2 cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for LAN-5 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for DAOY cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh41 cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
Rh30 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh30 cells 29435139
U-2 OS qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for U-2 OS cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for OHS-50 cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh41 cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for NB1643 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-MC cells 29435139
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for TC32 cells 29435139
Rh18 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh18 cells 29435139
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 539.62 Formula

C31H33N5O4

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 656247-17-5 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi BIBF 1120, Intedanib Smiles CN1CCN(CC1)CC(=O)N(C)C2=CC=C(C=C2)N=C(C3=CC=CC=C3)C4=C(NC5=C4C=CC(=C5)C(=O)OC)O

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 10 mg/mL (18.53 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
VEGFR2
(Cell-free assay)
13 nM
VEGFR3
(Cell-free assay)
13 nM
LCK
(Cell-free assay)
16 nM
FLT3
(Cell-free assay)
26 nM
VEGFR1
(Cell-free assay)
34 nM
FGFR2
(Cell-free assay)
37 nM
PDGFRα
(Cell-free assay)
59 nM
PDGFRβ
(Cell-free assay)
65 nM
FGFR1
(Cell-free assay)
69 nM
FGFR3
(Cell-free assay)
108 nM
Src
(Cell-free assay)
156 nM
Lyn
(Cell-free assay)
195 nM
FGFR4
(Cell-free assay)
610 nM
In vitro

BIBF1120 inibisce l'attività chinasica di PDGFR dei tipi PDGFR alfa e PDGFR beta con valori di IC50 di 59 nM e 65 nM, rispettivamente. Inoltre, BIBF1120 sopprime i sottotipi di FGFR con IC50 di 60 nM, 37 nM e 108 nM per FGFR1, FGFR2 e FGFR3, rispettivamente. BIBF1120 si lega al sito di legame dell'ATP nella fessura tra i lobi ammino e carbossi-terminali del dominio chinasico. Lo scaffold indolinone forma due legami idrogeno con l'azoto dello scheletro di Cys919 e l'ossigeno carbonilico dello scheletro di Glu917 nella regione del cerniera. BIBF 1120 inibisce la proliferazione delle BRP stimolate da PDGF-BB con una EC50 di 79 nM in saggi cellulari. BIBF1120 a concentrazioni fino a 100 nM blocca l'attivazione di MAPK dopo stimolazione con 5% di siero più PDGF-BB. In colture di cellule muscolari lisce vascolari umane (HUASMC), BIBF1120 previene la proliferazione stimolata da PDGF-BB con una EC50 di 69 nM.

Saggio chinasico
Saggio chinasi VEGFR2
Il dominio tirosina chinasico citoplasmatico di VEGFR2 (residui 797-1355 secondo la sequenza depositata nella banca dati SWISS-PROT P35968) viene clonato in pFastBac fuso a GST ed estratto. L'attività enzimatica viene saggiata in presenza o assenza di diluizioni seriali di BIBF1120 eseguite in DMSO al 25%. Ogni piastra per microtitolazione contiene controlli interni come il bianco, la reazione massima e il composto di riferimento storico. Tutte le incubazioni vengono condotte a temperatura ambiente su uno shaker rotante. 10 μL di ogni diluizione di BIBF1120 vengono aggiunti a 10 μL di chinasi diluita (0,8 μg/mL VEGFR2, 10 mM Tris pH 7,5, 2 mM EDTA e 2 mg/mL BSA) e preincubati per 1 ora. La reazione viene avviata aggiungendo 30 μL di miscela di substrato contenente 62,4 mM Tris pH 7,5, 2,7 mM DTT, 5,3 mM MnCl2, 13,3 mM Mg-acetato, 0,42 mM ATP, 0,83 mg/mL Poly-Glu-Tyr(4:1) e 1,7 μg/mL Poly-Glu-Tyr(4:1)-biotina e incubata per 1 ora. La reazione viene arrestata aggiungendo 50 μL di 250 mM EDTA, 20 mM HEPES, pH 7,4. 90 μL della miscela di reazione vengono trasferiti su una piastra di streptavidina e incubati per 1-2 ore. Dopo tre lavaggi con PBS, viene aggiunto l'anticorpo marcato con EU, PY20 (diluizione raccomandata 1:2000 di 0,5 mg/mL di anticorpo marcato in tampone di saggio DELFIA). L'eccesso di anticorpo di rilevazione viene rimosso con tre lavaggi di tampone di lavaggio DELFIA. Quindi, 10 minuti prima della misurazione sul lettore multilabel, ogni pozzetto viene incubato con 100 μL di soluzione di potenziamento DELFIA.
In vivo

In tutti i modelli tumorali testati finora, inclusi xenotrapianti tumorali umani cresciuti in topi nudi e un modello di tumore di ratto singenico, BIBF1120 è altamente attivo a dosi ben tollerate (25-100 mg/kg al giorno p.o.). Ciò è evidente nell'imaging a risonanza magnetica della perfusione tumorale dopo 3 giorni, riducendo la densità e l'integrità vascolare dopo 5 giorni, e una profonda inibizione della crescita.

Riferimenti

Applicazioni (Applications)

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot p-EGFR / FGFR1 / p-AKT / AKT / p-ERK / ERK Cyclin A / Cyclin D1 / Cyclin E / CDK2 / CDK4 / CDK6 p-SMAD3 / SMAD3 / p-p38 MAPK / p38 MAPK Fibronectin / Collagen 1a1
S1010-WB4
27581340
Immunofluorescence Vimentin / E-cadherin
S1010-IF1
29934570

Informazioni sullo studio clinico (Clinical Trial Information)

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT Reclutamento Condizioni Sponsor/Collaboratori Data di inizio Fasi
NCT06200714 Recruiting
Idiopathic Pulmonary Fibrosis|Diarrhoea
Boehringer Ingelheim
April 30 2024 --
NCT05676112 Withdrawn
Pulmonary Fibrosis
Boehringer Ingelheim|China-Japan Friendship Hospital
December 29 2023 --
NCT06070610 Completed
Healthy
Boehringer Ingelheim
November 8 2023 Phase 1
NCT05755308 Not yet recruiting
Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS
October 2023 Not Applicable
NCT06071013 Not yet recruiting
Non-small Cell Lung Cancer|EGFR Gene Mutation|EGFR-TKI Resistant Mutation
China Medical University Hospital
September 28 2023 Phase 1|Phase 2