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Xevinapant (AT406) IAP antagonist

N. Cat.: S2754

Xevinapant (AT406, ARRY-334543, Debio1143, SM-406) is a potent Smac mimetic and an antagonist of IAP (inhibitor of apoptosis protein via E3 ubiquitin ligase), binding to XIAP-BIR3, cIAP1-BIR3 and cIAP2-BIR3 with Ki of 66.4 nM, 1.9 nM, and 5.1 nM, 50- to 100-fold higher affinities than the Smac AVPI peptide. Phase 1.
Xevinapant (AT406) IAP antagonist Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 561.71

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.96%
99.96

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
EVSA-T Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human sensitive EVSA-T cells assessed as inhibition of cell growth after 72 hrs by Alamar Blue assay, EC50 = 0.0021 μM. 26218264
MDA-MB-231 Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human sensitive MDA-MB-231 cells assessed as inhibition of cell growth after 72 hrs by Alamar Blue assay, EC50 = 0.019 μM. 26218264
HEK293 Function assay 2 hrs Antagonist activity at full-length FLAG-tagged XIAP (unknown origin) transfected in HEK293 cells assessed as inhibition of interaction with caspase 9 after 2 hrs by immunoprecipitation assay, EC50 = 0.034 μM. 26218264
SKOV3 Growth inhibition assay 4 days Growth inhibition of human SKOV3 cells after 4 days by WST8 assay, IC50 = 0.142 μM. 21443232
MDA-MB-231 Growth inhibition assay 4 days Growth inhibition of human MDA-MB-231 cells after 4 days by WST8 assay, IC50 = 0.144 μM. 21443232
MDA-MB-231 Function assay 10 nM Induction of degradation of cIAP1 in human MDA-MB-231 cells at 10 nM by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Function assay 100 nM 15 mins Induction of degradation of cIAP1 in human MDA-MB-231 cells at 100 nM after 15 mins by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Apoptosis assay 1.5 uM 12 hrs Induction of apoptosis in human MDA-MB-231 cells assessed as activation of caspase-3 activity at 1.5 uM after 12 hrs by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Apoptosis assay 1.5 uM 12 hrs Induction of apoptosis in human MDA-MB-231 cells assessed as activation of PARP cleavage at 1.5 uM after 12 hrs by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Antitumor assay 30 mg/kg 2 weeks Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in SCID mouse assessed inhibition of tumor growth at 30 mg/kg, po administered daily for 5 days/week for 2 weeks 21443232
MDA-MB-231 Antitumor assay 100 mg/kg 2 weeks Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in SCID mouse assessed inhibition of tumor growth at 100 mg/kg, po administered daily for 5 days/week for 2 weeks 21443232
MDA-MB-231 Antitumor assay 100 mg/kg every 3 days Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in Balb/c SCID mouse assessed as tumor growth inhibition at 100 mg/kg, po qd measured every 3 days 26218264
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Saos-2 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-MC cells 29435139
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for TC32 cells 29435139
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 561.71 Formula

C32H43N5O4

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 1071992-99-8 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi ARRY-334543, Debio1143, SM-406 Smiles CC(C)CC(=O)N1CCC2CCC(N2C(=O)C(C1)NC(=O)C(C)NC)C(=O)NC(C3=CC=CC=C3)C4=CC=CC=C4

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 112 mg/mL (199.39 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 112 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
cIAP1-BIR3
(cell-free assay)
1.9 nM(Ki)
cIAP2-BIR3
(cell-free assay)
5.1 nM(Ki)
XIAP-BIR3
(cell-free assay)
66.4 nM(Ki)
In vitro
AT-406 is a Smac mimetic and appears to mimic closely the AVPI peptide in both hydrogen bonding and hydrophobic interactions with XIAP, with additional hydrophobic contacts with W323 of XIAP. AT-406 is more sensitive to these IAPs than Smac AVPI peptide with 50-100 fold binding affinities. AT-406 (at 1 μM) completely restores the activity of caspase-9, which is suppressed by 500 nM XIAP BIR3 in a cell-free system. In MDA-MB-231 cell, AT-406 induces rapid cellular cIAP1 degradation and also pulls down the cellular XIAP protein. AT-406 effectively inhibits lots of human cancer cell lines and shows IC50 of 144 and 142 nM in MDA-MB-231 cell and SK-OV-3 ovarian cell, with low toxicity against normal-like human breast epithelial MCF-12F cells and primary human normal prostate epithelial cells. AT-406 induces apoptosis in MDA-MB-231 cell by inducing activation of caspase-3 and cleavage of PARP.
Saggio chinasico
Saggi basati sulla polarizzazione di fluorescenza per le proteine XIAP, cIAP1 e cIAP2 BIR3
FL-AT-406 (l'AT-406 marcato fluorescentemente) è impiegato per sviluppare una serie di nuovi saggi FP per la determinazione delle affinità di legame dei mimetici di Smac alle proteine XIAP, cIAP-1 e cIAP-2 BIR3. Il valore di Kd di FL-AT-406 per ogni proteina IAP viene determinato mediante esperimenti di titolazione utilizzando una concentrazione fissa di FL-AT-406 e diverse concentrazioni della proteina fino alla completa saturazione. I valori di polarizzazione di fluorescenza vengono misurati utilizzando un lettore di piastre Infinite M-1000 in piastre Microfluor 2 a 96 pozzetti, nere, con fondo rotondo. A ciascun pozzetto vengono aggiunti FL-AT-406 (2, 1 e 1 nM per esperimenti con XIAP BIR3, cIAP-1 BIR3 e cIAP-2 BIR3, rispettivamente) e diverse concentrazioni della proteina a un volume finale di 125 μL nel tampone di saggio (100 mM fosfato di potassio, pH 7,5, 100 μg/mL γ-globulina bovina, 0,02% azide di sodio, con 4% DMSO). Le piastre vengono mescolate e incubate a temperatura ambiente per 2-3 ore con agitazione delicata. I valori di polarizzazione in unità di millipolarizzazione (mP) vengono misurati a una lunghezza d'onda di eccitazione di 485 nm e una lunghezza d'onda di emissione di 530 nm. Le costanti di dissociazione di equilibrio (Kd) vengono quindi calcolate adattando gli aumenti di FP sigmoidi dose-dipendenti in funzione delle concentrazioni proteiche utilizzando il software Graphpad Prism 5.0. In esperimenti di legame competitivo per XIAP3 BIR3, AT-406 viene incubato con 20 nM di proteina XIAP BIR3 e 2 nM di FL-AT-406 nel tampone di saggio (100 mM fosfato di potassio, pH 7,5; 100 μg/mL γ-globulina bovina; 0,02% azide di sodio). Negli esperimenti di legame competitivo per la proteina cIAP1 BIR3, vengono utilizzati 3 nM di proteina e 1 nM di FL-AT-406. Negli esperimenti di legame competitivo per cIAP2 BIR3, vengono utilizzati 5 nM di proteina e 1 nM di FL-AT-406. Per ogni esperimento di legame competitivo, i valori di polarizzazione vengono misurati dopo 2-3 ore di incubazione utilizzando un lettore di piastre Infinite M-1000. Il valore IC50, la concentrazione dell'inibitore alla quale il 50% del tracciante legato viene spostato, viene determinato dal grafico utilizzando l'analisi dei minimi quadrati non lineare. L'adattamento della curva viene eseguito utilizzando il software PRISM. Viene calcolato un valore Ki per AT-406.
In vivo
AT-406 has good pharmacokinetic (PK) properties and oral bioavailability in mice, rats, non-human primates, and dogs. In the MDA-MB-231 xenograft, AT-406 effectively induces cIAP1 degradation and processing of procaspase-8, cleavage of PARP in tumor tissues at 100 mg/kg with well toleration even at 200 mg/kg. AT-406 induces significant tumor growth inhibition with p of 0.0012 at 100 mg/kg.
Riferimenti

Applicazioni (Applications)

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot cIAP-1 / XIAP / Mcl-1 / pS6K1 / Cleaved PARP
S2754-WB1
28036295
Growth inhibition assay Cell viability
S2754-viability1
28036295

Informazioni sullo studio clinico (Clinical Trial Information)

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT Reclutamento Condizioni Sponsor/Collaboratori Data di inizio Fasi
NCT01265199 Terminated
Acute Myelogenous Leukemia (AML)
Ascenta Therapeutics|The Leukemia and Lymphoma Society
February 2011 Phase 1
NCT01078649 Completed
Cancer|Solid Tumors|Lymphoma|Malignancy
Debiopharm International SA
March 29 2010 Phase 1