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SNS-032 (BMS-387032) CDK inhibitor

N. Cat.: S1145

SNS-032 (BMS-387032) has firstly been described as a selective inhibitor of CDK2 with IC50 of 48 nM in cell-free assays and is 10- and 20-fold selective over CDK1/CDK4. It is also found to be sensitive to CDK7/9 with IC50 of 62 nM/4 nM, with little effect on CDK6. This compound induces apoptosis.
SNS-032 (BMS-387032) CDK inhibitor Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 380.53

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.75%
99.75

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
human A2780 cell line Proliferation assay 72 h Antiproliferative effect against human A2780 cell line was determined in a whole cell 72 hr cytotoxicity assay, IC50=95 nM 15027863
Sf21 Function assay Inhibition of recombinant human full length C-terminal His6-tagged CDK9/cyclin T1 expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using PDKtide as substrate, IC50=0.004μM 27171036
Sf21 Function assay Inhibition of human full length C-terminal His6-tagged CDK2/N-terminal GST-tagged cyclin A expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using histone H1 as substrate, IC50=0.038μM 27171036
Sf21 Function assay Inhibition of recombinant human full length C-terminal His6-tagged CDK2/N-terminal GST-tagged cyclin E expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using histone H1 as substrate, IC50=0.048μM 27171036
Sf21 Function assay Inhibition of recombinant human full length C-terminal His6-tagged CDK7/cyclin H/N-terminal GST-tagged MAT1 expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using cdk7 substrate peptide, IC50=0.062μM 27171036
Sf21 Function assay Inhibition of recombinant human full length N-terminal His6-tagged CDK5/N-terminal GST-tagged p25 expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using histone H1 as substrate, IC50=0.34μM 27171036
HCT116 Function assay 16 hrs Inhibition of CDK9 in human HCT116 cells assessed as phosphor-ser2 level of RNA polymerase 2 after 16 hrs by high content cellular assay, IC50=0.458μM 18842409
Sf21 Function assay Inhibition of human full length C-terminal His6-tagged CDK1/N-terminal GST-tagged cyclin B expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using histone H1 as substrate, IC50=0.48μM 27171036
HCT116 Function assay 16 hrs Inhibition of CDK9-mediated RNA pol 2 phosphorylation at ser2 in human HCT116 cells after 16 hrs by HCS assay, IC50=0.55μM 18926699
HCT116 Antiproliferative assay 24 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 24 hrs by MTT assay, IC50=0.7μM 30197029
Sf cells Function assay Inhibition of recombinant human N-terminal GST-tagged CDK4/cyclin D1 expressed in baculovirus infected sf cells, IC50=0.925μM 27171036
MCF7 Antiproliferative assay 24 hrs Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 24 hrs by MTT assay, IC50=1μM 30197029
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for TC32 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Saos-2 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh41 cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for NB1643 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for A673 cells) 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for BT-12 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for LAN-5 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SJ-GBM2 cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for BT-37 cells 29435139
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for TC32 cells 29435139
U-2 OS qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for U-2 OS cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh41 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for RD cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Saos-2 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for OHS-50 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-SH cells 29435139
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 380.53 Formula

C17H24N4O2S2

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 345627-80-7 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi N/A Smiles CC(C)(C)C1=CN=C(O1)CSC2=CN=C(S2)NC(=O)C3CCNCC3

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 76 mg/mL (199.72 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 30 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
CDK9/CyclinT
(Cell-free assay)
4 nM
CDK2/CyclinA
(Cell-free assay)
38 nM
CDK2/CyclinE
(Cell-free assay)
48 nM
CDK7/CyclinH
(Cell-free assay)
62 nM
GSK-3α
(Cell-free assay)
230 nM
CDK5/p35
(Cell-free assay)
340 nM
In vitro

SNS-032 (BMS-387032) ha una bassa sensibilità a CDK1 e CDK4 con IC50 di 480 nM e 925 nM, rispettivamente. Questo composto uccide efficacemente le cellule di leucemia linfocitica cronica in vitro indipendentemente dagli indicatori prognostici e dalla storia del trattamento. Rispetto al flavopiridolo e alla roscovitina, questo agente è più potente, sia nell'inibizione della sintesi dell'RNA che nell'induzione dell'apoptosi. La sua attività è prontamente reversibile; la rimozione di questo composto riattiva l'RNA polimerasi II, che porta alla risintesi di Mcl-1 e alla sopravvivenza cellulare.

Questo inibitore inibisce la formazione tridimensionale di reti capillari di cellule endoteliali. Impedisce completamente la formazione di capillari di HUVEC mediata dalle cellule U87MG. Inoltre, questa sostanza chimica previene significativamente la produzione di VEGF in entrambe le linee cellulari, previene l'angiogenesi in vitro, e questa azione è attribuibile al blocco del VEGF. Studi preclinici hanno dimostrato che questo composto induce l'arresto del Cell Cycle e l'apoptosi in diverse linee cellulari.

Questo agente blocca il Cell Cycle tramite l'inibizione delle CDK 2 e 7, e la trascrizione tramite l'inibizione delle CDK 7 e 9. La sua attività non è influenzata dal siero umano.

Questo composto induce un aumento dose-dipendente della colorazione con annessina V e dell'attivazione della caspasi-3. A livello molecolare, induce una marcata defosforilazione della serina 2 e 5 della RNA polimerasi (RNA Pol) II e inibisce l'espressione di CDK2 e CDK9 e della CDK7 defosforilata.

In vivo

SNS-032 (BMS-387032) previene la secrezione di VEGF indotta dalle cellule tumorali in un modello di cocultura tumorale.

Questo composto, un nuovo inibitore di CDK, è più selettivo e meno citotossico e ha dimostrato di prolungare la malattia stabile nei tumori solidi.

Riferimenti
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21212792/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22447844/

Applicazioni (Applications)

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot p-RNA PolII / RNA Pol II / CDK7 / CDK9 YAP / p-YAP / CTGF / CYR61 p-ROCK / ROCK / p-LIMK1/2 / LIMK1/2 / p-Cofilin / Cofilin Mcl-1 / Cyclin D1 / Bcl-2 / PARP
S1145-WB1
31526394
Growth inhibition assay Cell viability
S1145-viability1
20663900

Informazioni sullo studio clinico (Clinical Trial Information)

(dati da https://clinicaltrials.gov, aggiornato il 2024-05-22)

Numero NCT Reclutamento Condizioni Sponsor/Collaboratori Data di inizio Fasi
NCT00446342 Completed
B-lymphoid Malignancies|Chronic Lymphocytic Leukemia|Mantle Cell Lymphoma|Multiple Myeloma
Sunesis Pharmaceuticals
February 2007 Phase 1