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PHA-793887 CDK inhibitor

N. Cat.: S1487

PHA-793887 is a novel and potent inhibitor of CDK2, CDK5 and CDK7 with IC50 of 8 nM, 5 nM and 10 nM. It is greater than 6-fold more selective for CDK2, 5, and 7 than CDK1, 4, and 9. This compound induces cell-cycle arrest and apoptosis. Phase 1.
PHA-793887 CDK inhibitor Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 361.48

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: S148701 DMSO]72 mg/mL]false]Ethanol]72 mg/mL]false]Water]Insoluble]false Purezza: 99.64%
99.64

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
human A2780 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human A2780 cells after 72 hrs by fluorescence assay, IC50=0.09 μM
human HCT116 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.163 μM
human COLO205 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human COLO205 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.188 μM
human C-433 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human C-433 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.285 μM
human DU145 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human DU145 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.303 μM
human A375 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human A375 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.396 μM
human PC3 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human PC3 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.601 μM
human MCF7 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=1.284 μM
human BxPC3 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human BxPC3 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=3.444 μM
human A2780 cells Function assay 3 μM Inhibition of CDK in human A2780 cells assessed as accumulation of hypophosphorylated form of retinoblastoma protein at 3 uM by immunohistochemistry
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 361.48 Formula

C19H31N5O2

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 718630-59-2 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi N/A Smiles CC(C)CC(=O)NC1=NNC2=C1CN(C2(C)C)C(=O)C3CCN(CC3)C

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 72 mg/mL (199.18 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Ethanol : 72 mg/mL

Water : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Caratteristiche
Multi-CDK inhibitor.
Targets/IC50/Ki
CDK5/p25
(Cell-free assay)
5 nM
CDK2/CyclinA
(Cell-free assay)
8 nM
CDK2/CyclinE
(Cell-free assay)
8 nM
CDK7/CyclinH
(Cell-free assay)
10 nM
CDK1/CyclinB
(Cell-free assay)
60 nM
CDK4/CyclinD1
(Cell-free assay)
62 nM
GSK-3β
(Cell-free assay)
79 nM
CDK9/CyclinT1
(Cell-free assay)
138 nM
In vitro
PHA-793887 ha una bassa attività contro CDK1, CDK4, CDK9 e GSK3β con IC50 rispettivamente di 60 nM, 62 nM, 138 nM e 79 nM. Questo composto inibisce la proliferazione cellulare di molte linee cellulari tumorali, tra cui A2780, HCT-116, COLO-205, C-433, DU-145, A375, PC3, MCF-7 e BX-PC3, con IC50 di 88 nM–3,4 μM. Esso (1 μM) mostra una diminuzione nella fase S, un successivo aumento della fase G1 e un leggero accumulo della fase G2/M nelle cellule A2780. Questa sostanza chimica (3 μM) aumenta significativamente la fase G2/M e riduce la sintesi del DNA. È citotossico per le linee cellulari leucemiche, tra cui K562, KU812, KCL22 e TOM1, con IC50 di 0,3–7 μM, ma non è citotossico per le cellule mononucleate del sangue periferico normali non stimolate o per le cellule staminali ematopoietiche CD34+. Nei saggi clonogenici, questo composto mostra un'attività molto elevata contro le linee cellulari leucemiche con IC50 inferiore a 0,1 μM. Induce l'arresto del Cell Cycle, inibisce la fosforilazione di Rb e nucleofosmina, modula l'espressione di ciclina E e cdc6 a 0,2−1 μM e induce Apoptosis related a 5 μM.
Saggio chinasico
Saggio della chinasi CDK
L'attività biochimica dei composti è determinata mediante incubazione con enzimi e substrati specifici, seguita dalla quantificazione del prodotto fosforilato. PHA-793887 (1,5 nM–10 μM) viene incubato per 30-90 min a temperatura ambiente in presenza di una miscela di ATP/33P-γ-ATP, substrato e l'enzima specifico (0,7-100 nM) in un volume finale di 30 μL di tampone chinasico, utilizzando piastre da 96 pozzetti a fondo a U. Dopo l'incubazione, la reazione viene interrotta e il substrato fosforilato viene separato dall'ATP radioattivo non incorporato utilizzando biglie SPA, resina Dowex o un filtro in fosfocellulosa Multiscreen come segue: (1) Per i saggi SPA. La reazione viene interrotta mediante l'aggiunta di 100 μL di PBS + 32 mM EDTA + 0,1% Triton X-100 + 500 μM ATP, contenente 1 mg di biglie SPA rivestite di streptavidina. Dopo 20 min di incubazione per la cattura del substrato, 100 μL della miscela di reazione vengono trasferiti in piastre Optiplate da 96 pozzetti contenenti 100 μL di CsCl 5 M, lasciati riposare per 4 ore per consentire la stratificazione delle biglie sulla parte superiore della piastra e contati utilizzando TopCount per misurare il fosfato incorporato nel substrato. (2) Per il saggio su resina Dowex. Viene aggiunta una quantità di 150 μL di resina/formiato, pH 3,00, per interrompere la reazione e catturare l'33P-γ-ATP non reagito, separandolo dal substrato fosforilato in soluzione. Dopo 60 min di riposo, 50 μL di supernatante vengono trasferiti in piastre Optiplate da 96 pozzetti. Dopo l'aggiunta di 150 μL di Microscint 40, la radioattività viene contata nel TopCount. (3) Per il saggio Multiscreen. La reazione viene interrotta con l'aggiunta di 10 μL di EDTA (150 mM). Una quantità di 100 μL viene trasferita su una piastra MultiScreen per consentire il legame del substrato al filtro in fosfocellulosa. Le piastre vengono quindi lavate tre volte con 100 μL di H2PO4 (75 mM) filtrato tramite un sistema di filtrazione MultiScreen ed essiccate. Dopo l'aggiunta di 100 μL di Microscint 0, la radioattività viene contata nel TopCount. I valori di IC50 sono ottenuti mediante analisi di regressione non lineare.
In vivo
PHA-793887 (10–30 mg/kg) mostra una buona efficacia nei modelli di xenotrapianto di carcinoma umano ovarico A2780, del colon HCT-116 e pancreatico BX-PC3. Questo composto (20 mg/kg) è efficace nei modelli di xenotrapianto di cellule K562 e HL60, in un modello leucemico disseminato primario e in un modello ALL-2 disseminato ad alto carico derivato da un paziente con leucemia linfoblastica acuta Philadelphia-positivo in ricaduta.
Riferimenti