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3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride EZH2 inhibitor

N. Cat.: S7120

DZNeP (3-deazaneplanocin A) HCl, an analog of adenosine, is a competitive inhibitor of S-adenosylhomocysteine hydrolase with Ki of 50 pM in a cell-free assay.
3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride Histone Methyltransferase inhibitor Chemical Structure

Struttura chimica

Peso molecolare: 298.73

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Controllo Qualità (Quality Control)

Lotto: Purezza: 99.92%
99.92

Coltura cellulare, trattamento e concentrazione di lavoro
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Linee cellulari Tipo di saggio Concentrazione Tempo di incubazione Formulazione Descrizione dell'attività PMID
human PC3 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human PC3 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=9.39 μM. 26010585
human A549 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human A549 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=1.4 μM. 26010585
human SNU638 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human SNU638 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.91 μM. 26010585
human SKHEP1 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human SKHEP1 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.72 μM. 26010585
human MDA-MB-231 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human MDA-MB-231 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.3 μM. 26010585
human HCT116 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human HCT116 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.26 μM. 26010585
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Informazioni chimiche, conservazione e stabilità (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecolare 298.73 Formula

C12H14N4O3.HCl

Conservazione (Dalla data di ricezione)
N. CAS 120964-45-6 Scarica SDF Conservazione delle soluzioni stock

Sinonimi NSC 617989 HCl Smiles C1=CN=C(C2=C1N(C=N2)C3C=C(C(C3O)O)CO)N.Cl

Solubilità (Solubility)

In vitro
Lotto:

DMSO : 60 mg/mL (200.85 mM)
(Il DMSO contaminato da umidità può ridurre la solubilità. Utilizzare DMSO fresco e anidro.)

Water : 60 mg/mL

Ethanol : Insoluble

Calcolatore di Molarità

Massa Concentrazione Volume Peso molecolare
Calcolatore di Diluizione Calcolatore del Peso Molecolare

In vivo
Lotto:

Calcolatore di formulazione in vivo (Soluzione chiara)

Passo 1: Inserire le informazioni di seguito (Consigliato: Un animale aggiuntivo per tenere conto della perdita durante l'esperimento)

mg/kg g μL

Passo 2: Inserire la formulazione in vivo (Questo è solo il calcolatore, non la formulazione. Contattateci prima se non c'è una formulazione in vivo nella sezione Solubilità.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Risultati del calcolo:

Concentrazione di lavoro: mg/ml;

Metodo per preparare il liquido master di DMSO: mg farmaco predissolto in μL DMSO ( Concentrazione del liquido master mg/mL, Vi preghiamo di contattarci prima se la concentrazione supera la solubilità del DMSO del lotto del farmaco. )

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungereμL PEG300, mescolare e chiarire, quindi aggiungereμL Tween 80, mescolare e chiarire, quindi aggiungere μL ddH2O, mescolare e chiarire.

Metodo per preparare la formulazione in vivo: Prendere μL DMSO liquido master, quindi aggiungere μL Olio di mais, mescolare e chiarire.

Nota: 1. Si prega di assicurarsi che il liquido sia limpido prima di aggiungere il solvente successivo.
2. Assicurarsi di aggiungere il/i solvente/i in ordine. È necessario assicurarsi che la soluzione ottenuta, nell'aggiunta precedente, sia una soluzione limpida prima di procedere all'aggiunta del solvente successivo. Metodi fisici come il vortex, gli ultrasuoni o il bagno d'acqua calda possono essere utilizzati per facilitare la dissoluzione.

Meccanismo d'azione (Mechanism of Action)

Caratteristiche
Carbocyclic analog of adenosine, and acts as anti-tumor and anti-virus inhibitor of EZH2.
Targets/IC50/Ki
S-adenosylhomocysteine hydrolase
50 pM(Ki)
In vitro

3-Deazaneplanocin A (1.0 μM) results in a significant increase in accumulation of cells in the G0/G1 phase (58.5%) with a concomitant decrease in the number of cells in S phase (35.2%) and G2/M phases (6.3%) of the cell cycle of human acute myeloid leukemia OCI-AML3 cells. 3-Deazaneplanocin A (1.0 μM) induces apoptosis in OCI-AML3 (~50%) and HL-60 cells (~50%), and a more than 90% reduction in colony growth at 48 hr. 3-Deazaneplanocin A depletes EZH2 levels, and inhibits trimethylation of lysine 27 on histone H3 in the HL-60 and OCI-AML3 cells and in primary AML cells. 3-Deazaneplanocin A treatment induces p16, p21, p27, and FBXO32 while depleting cyclin E and HOXA9 levels. 500 nM 3-Deazaneplanocin A induces differentiation of HL-60 to CD11b+ cell by nearly 3-folds time at 48 h. 3-Deazaneplanocin A has excellent activity against several viral types. 3-Deazaneplanocin A is activity against vesicular stomatitis in L929 cells, parainfluenza 3 in H.Ep-2, vaccinia and yellow fever viruses in vero cells with IC50 of 0.2, 3.6, 2.1 and 2.9 μg/mL, respectively. 3-Deazaneplanocin A displays a strongly and uniformly leishmanistatic effect on American Leishmania (L mexicana and L brasiliensis) strains in the study with average ID50 of 96 ng/mL, but shows no inhibition against the several T. cruzi and T. rangeli strains tested with concentrations up to 10 μg/mL. At a dose of 200 ng/mL, 3-Deazaneplanocin A inhibits S-adenosyl-L-3H-methylmethionine and 3-thymidine incorporation by promastigotes after four days. At a dose of 100 ng/mL, 3-Deazaneplanocin A eliminates approximately 56% of the L mexicana and L brasiliensis from infected human macrophages.

Saggio chinasico
Saggio di attività dell'S-adenosilomocisteina idrolasi
La miscela di reazione utilizzata per il saggio di AdoHcyase contiene, in un volume finale di 0,5 mL, 50 mM di fosfato di potassio (pH 7,6), 5 mM di ditiotreitolo, 1 mM di EDTA, 10% di glicerolo e l'enzima. L-[8- 14C]AdoHcy è utilizzato come substrato e sono incluse 5 unità di adenosina deaminasi intestinale di vitello. La reazione viene interrotta con l'aggiunta di 100 μL di acido formico 5 M, e la miscela di reazione viene quindi versata su una colonna (0,8×2,5 cm) di SP-Sephadex C-25, precedentemente equilibrata in acido formico 0,1 M. Ogni provetta viene risciacquata con 0,5 mL di acido formico 0,1 M. La [14C]Inosina formata viene eluita dalla colonna con 3,5 mL di acido formico 0,1 M in una fiala per scintillazione. La radioattività viene determinata dopo l'aggiunta di 10 mL di liquido di scintillazione. La quantità di enzima utilizzata è di circa 105 pU, o 75 ng dell'enzima purificato. Un'unità è la quantità di enzima necessaria per formare 1 pmol di prodotto in 1 min a 37 ℃.
In vivo

3-Deazaneplanocin A shows antileukemia activity in vivo. 3-Deazaneplanocin A at the doses of 8 mg/kg shows in vivo antiviral activity against vaccinia virus in a mouse tailpox assay with median of 0.0 poxftail (84% protection). 3-Deazaneplanocin A at the doses ranging from 0.5 to 1.5 mg/kg/day, significantly reduced development of cutaneous leishmanial infection produced in inbred BALB/c mice by L. b. guyanensis inoculation. 3-Deazaneplanocin A induces massively increased interferon-α production in Ebola virus-infected mice. 3-Deazaneplanocin A (s.c. injection of 2 mg/kg postinfection) prevents death in mice infected with 1000 pfu (30 000 LD50) of mouse-adapted EBO-Z. Treatment with 3-Deazaneplanocin A on day 1 reduces mean serum viral titers on day 2 by 100-fold and on day 3 by 100 000-fold, compared with placebo controls, and results in a mean serum IFN-α level of 1420 pg/mL on day 2 and 1830 pg/mL on day 3.

Riferimenti
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9347954/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12076759/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6639063/

Applicazioni (Applications)

Metodi Biomarcatori Immagini PMID
Western blot EZH2 / H3K27me3 Suz12 / H3K4me3 / H3K36me2 TGFBR1 / TGFBR2 / Smad3 EED / p21 / p-RB / p27 / p-CDC2 HOXA6 / HOXB3 / HOXC4 / HOXD13 p-JNK / JNK / p-p38 / p38 / p-ERK / ERK / p-IκB-α / IκB-α
S7120-WB1
27223261
Immunofluorescence α-tubulin F-actin / Paxillin EZH2 / Mst1
S7120-IF1
27226494
Growth inhibition assay Cell viability
S7120-viability1
27223261